石蜡包埋切片实验基本步骤主要有以下几步：
1、取材：新鲜组织固定于4%多聚甲醛24h以上。将组织从固定液取出在通风橱内用手术刀将目的部位组织修平整，将修切好的组织和对应的标签放于脱水盒内。
2、脱水：将脱水盒放进吊篮里于脱水机内依次梯度酒精进行脱水。75%酒精4h-85%酒精2h-90%酒精2h-95%酒精1h-无水乙醇I 30min-无水乙醇II 30min-醇苯5-10min-I5-10min-II5-10min-蜡I1h-蜡II1h-蜡III 1h。
3、包埋：将浸好蜡的组织于包埋机内进行包埋。先将融化的蜡放入包埋框，待蜡凝固之前将组织从脱水盒内取出按照包埋面的要求放入包埋框并贴上对应的标签。于-20°冻台冷却，蜡凝固后将蜡块从包埋框中取出并修整蜡块。
4、切片：将修整好的蜡块置于石蜡切片机上切片，片厚4μm。切片漂浮于摊片机40℃温水上将组织展平，用载玻片将组织捞起，并放进60℃烘箱内烤片。待水烤干蜡烤化后取出常温保存备用。
生物组织石蜡包埋切片是组织学切片技术中应用广泛的方法。 例如（hematoxylin;h(a)ematine）— 伊红染色法 (
hematoxylin-eosin staining ) ，简称HE染色法 ，石蜡切片技术里常用的染色法之一 。（hematoxylin;h(a)ematine ）染液为碱性 ，主要使细胞核内的染色质与胞质内的核酸着紫蓝色 ；伊红为酸性染料 ，主要使细胞质和细胞外基质中的成分着红色 。HE染色法是组织学、胚胎学、病理学教学与科研中基本、使用广泛的技术方法。
常见的生物切片，厚度一般在几微米的程度，这种厚度制作起来比较简单，除了可以使用自动化的设备来切片之外，手动操作也能切到这种厚度，而且完够满足光学显微镜下观察的标准。不过在前沿的科研领域里，需要观察更细微的细胞结构，植物叶片石蜡切片检测服务，甚至需要从分子的层面来进行研究，这时候就需要用到电子显微镜。然而电子显微镜也需要更薄的样品，切片至少要达到0.1微米的厚度，而这种切片也就被称为是超薄切片，在很多实验研究里需要厚度达到50纳米，显然手I操作是无法达到这种厚度的。那么在实验环境下是怎样做成这种超薄生物切片的呢首先是需要进行更好的固定，因为在如此薄的尺度之下，不但基本的细胞结构都已经被完全破坏，而且其中的细胞器也都被切开，里面的生物酶会释放出来，并且在很短的时间内使细胞结构遭到破坏。所以就需要在取得样品之后尽快进行固定，要求在一-分钟之 内完成这项操作，然后再使用对应的材料来做透明化以及包埋，接下来还需要配合的切片机来完成切片的过程，从而达到理想的厚度。
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