在谷朊粉的深加工方面，发酵法较酶解法具有更多的优势，发酵法能产生较多酶系，酶切位点相对较多，因此可产生更多的小肽或氨基酸。发酵法更容易降低生产成本。因此，越来越多的重视，研究开发新的谷朊粉降解工艺技术，包括发酵、及发酵和酶解相结合等方法，使得大规模生产生物活性成分成为可能。酶解谷朊粉因其专一性高，能够降解大分子蛋白，并能产生一些具有生物活性成分而成为谷朊粉研究的热点。
研究人员也从谷朊粉中提取得到了谷氨酰胺肽。谷氨酰胺(Gln)在代谢中有许多重要的生理功能，但是它的溶解度低，谷元粉批发，且在溶液中不稳定。而酶法水解谷朊粉得到的结合态谷氨酰胺肽，相对稳定，是游离谷氨酰胺的替代品。研究人员发现谷氨酰胺肽具有多种生理活性，与活性细胞密切相关。它能加速细胞增殖，增强肠道功能。除此之外，谷氨酰胺肽还是谷胱gan肽合成的前提，宁夏谷元粉，是生物体内抗yang化清除自由基的主要来源。
马丁法是在手工分离小麦面筋和淀粉方法的基础上形成的一种相对较简单的面筋和淀粉分离方法，也叫水洗小麦谷朊粉和淀粉分离工艺，其原理是而粉加水形成面团，再用追加的水反复连续洗涤，从而将淀粉渐渐地作为淀粉悬浮液（淀粉浆）分离出去。在重力作用下，或在离心分离器，或水力旋流分离器中，淀粉从悬浮液中沉淀出来;另外，也可以用筛子从悬浮液中分离，将剩下的黏胶状面筋球干燥而得谷朊粉。马丁法是早广泛应用的小麦淀粉和谷肮粉的生产方法，随着时间的推移，传统的马丁法被逐步改进，谷元粉价格，通过增加过程水的重新循环，以及采用新型淀粉和蛋白有效分离设备而降低新鲜水用量，分离每吨面粉的耗水量从(传统马丁法）面粉质量的15倍降低到7倍一9倍，目前国内广泛采用的是马丁法水洗工艺。
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