芽孢杆菌不仅可以直接吸附重金属离子，还可以通过影响土壤理化性质（包括土壤pH、阳离子交换量、有机质含量、氧化还原电位、土壤微生物等）来改变重金属在土壤中不同形态的分布。杨榕等研究发现胶质芽孢杆菌能分泌有机酸，降低植物根际土壤pH，从而提高土壤有效态Cd的含量，进一步证实了土壤有效态Cd与土壤pH呈负相关。胶质芽孢杆菌和巨大芽孢杆菌的解磷、解钾作用能增加土壤中的阳离子交
