到了新生代的第四纪，地球上发生了冰川，水杉抵抗不住冰川的，从此绝灭无存，只剩下了化石上的遗迹。可是实际上它并不是真正的全军覆没。当世界各地的水杉被冰川消灭时，却有少数水杉躲过了这场浩劫。其原因是第四纪时，虽然也广泛分布着冰川，但的冰川不像欧美那样成为整块的巨冰，而是零星分散的“山地冰川”，这种“山地冰川”从高山奔流直下，盖住了附近一带，却留下了不少无冰之处，一部分植物就可以在这样的“避难所”中继续
