自动化种菜移栽秧苗到达一定大小，必须及时移到其它容器栽植。如番茄、茄子等，一般有4─5片真叶时，瓜类不超过2─3片真叶，甘蓝类、白菜类在4─6片真叶时移植。移植时注意不要损伤秧苗幼嫩的根系。可在掘取菜苗前给土壤或基质充分浇水，使根部多带土壤或基质，不仅能减小对根部损伤，而且能减增加吸水力、移栽后成活快。一般叶菜类栽植深度以不使底部的叶片埋没，否则易引起腐烂。蔬菜可用土壤栽培，也可采用无土栽培的方式
