在许多环境下，杀菌剂是一个难以发明的潜伏问题，偶然和其他因素有关。在多数膜都须运行在无活性氯的环境中，细菌在膜外貌黏附、繁殖，并排泄粘液。杀菌剂作用的方式比较常见的是杀菌作用和抑菌作用。杀菌剂对于菌类毒性的表现是从多方便展现的，它们要求产水中不能有细菌的存在，议决膜的压力和膜两侧的压差渐渐增大。进料压力和压差渐渐增大，可直接影响，水质明显变坏，达不到划定尺度比较常见的是影响菌丝生长、
