生物脱硫原理，简单地说，就是在温和的条件下利用各种适宜的微生物菌群将化合态或有机态的硫释放出来的过程，主要利用的是特殊的微生物对含硫的环境污染或者含硫矿石有的消化能力，将原本存在于煤矿中的多种化合物的不同形态的硫转化成为水溶性的化合物；类似的，煤炭的微生物脱硫生物法是利用微生物选择性地氧化煤中的有机硫和无机硫，从而达到除去煤炭中硫的目的，其优点是微生物方法具有专一性和有效性，能够选择性地脱除煤炭中
