对微生物的杀灭作用次氯酸水能杀灭各种微生物，包括细菌繁殖体、病毒、真菌和芽孢等。应用悬液杀菌试验，消毒剂与菌悬液比例为100：1时，有效氯含量为50ml的次氯酸水，在室温下对弯曲、大肠、绿脓、金黄色、MRSA、白癬菌、革兰氏阴性需氧的杀灭时间均小于15s；在40℃时，对黑曲霉菌、枯草菌黑色变种芽孢的杀灭时间小于30s。同样在室温条件下有效氯含量50mg/L的次氯酸水15s即对病毒、诺如病毒
