次氯酸水可以用于卫生机构、各类公共场所、食品加工、餐饮店、家庭等多种场合各种对象的消毒，包括内窥镜、手术器械、疮口/创面、皮肤黏膜、空气、手部、物体表面和织物、水果蔬菜、餐饮具、二次供水设备设施的消毒等。次氯酸消毒剂效果受有机物多少、使用消毒剂浓度、温度等因素的影响。消毒对象体系中的有机物多，杀菌效果相对降低；消毒剂浓度增加、温度升高，均能使其杀菌作用增强。在未添加有机物的条件下悬液杀菌试
