食品生产企业应做好净化工程的实施工作，并合理布置、分区等，从而达到无菌要求。生产过程中，食品净化车间洁净工程重要的“事务”是排除或控制车间内的微生物、细菌等污染物的数量，保证食量安全；在食品包装方面，产品会放到真空的包装袋中，微生物因无氧气而无法繁殖。净化车间净化工程的合理布局是一个大问题，如面包生产企业，因各房间没有完全隔断的效果，面粉中含有大量的霉菌，在面粉搅拌中，面粉微粒子落到面包上
