虽然生态资产核算已开始应用于区域可持续发展决策之中, 国内外学界关于生态资产核算的争议从未停止。尤其是价格的界定本身就是一种人类行为, 并非是完全客观的, 不同人群对一项事物的价值认知可能存在很大差异。在已知生态资产核算结果具有不确定性的前提下, 研究赞成不应盲目将核算结果总量与经济总量直接对比, 而应当进一步设定具体的可持续发展决策状态或情景, 通过细化评估指标、明确决策对象来寻找相对可