鹅卵石的主要化学成分是二氧化硅，其次是少量的氧化铁以及锰、铜、铝、镁等微量元素和化合物。它们有不同的颜料，如红色的铁、蓝色的铜、紫色的锰、黄色半透明的二氧化硅胶体石浆、含有绿色矿物的祖母绿颜色等等。由于这些色素离子在二氧化硅热液中溶解的种类和含量不同，呈现出多种深浅不一的色调，使得鹅卵石呈现出黑、白、黄、红、墨绿、青灰等颜色。
