进出口货物报检流程大致可分为三步：
1.报检申请（报检人提供外贸合同、、提单、装箱单、等单证；实施安全质量许可、卫生检疫注册的应提交有关证明文件复印件，并在报检单上注名文件号）；
2.报检（将申请的相关信息录入CIQ2000系统，并将相关单证递交检验检疫局检务部门受理）；
3.施检部门施检（施检部门接受单据、确认、检验、结果登记、拟制证稿、审核签字）；
签发证书（检务部门对施检部门拟稿审核，并签发证书）。
入境货物的检验检疫工作程序可以分为：申请报检、受理报检、办理通关、实施检验检疫、放行
1）法定检验检疫入境货物的货主或其代理人首先向卸货口岸或到达站的出入境检验检疫机构申请报检。
2）检验检疫机构受理报检，转施检部门签署意见，计收费。
3）对来自疫区的、可能传播、动植物疫情的入境货物交通工具或运输包装实施必要的检疫、消毒、卫生除害处理后，签发《入境货物通关单》（入境废物、活动物等除外）供报检人办理海关的通关手续；
4）货物通关后，入境货物的货主或其代理人需在检验检疫机构规定的时间和地点到的检验检疫机构联系对货物实施检验检疫。
5）经检验检疫合格的入境货物签发《入境货物检验检疫证明》放行，经检验检疫不合格的货物签发检验检疫处理通知书，需要索赔的签发检验检疫证书。
报检规定
进口商品需在入境口岸报检，获取《入境货物通关单》，凭此向海关报关；出口商品一般应向口岸检验检疫机构报检，缅甸清关报检找哪家，取得出境口岸检验检疫机构签发的《出境货物通关单》，缅甸清关报检代理，凭此向海关报关。实施直通放行的商品，如其进出口经营企业获得质检总局的直通放行资格的，直接向出口商品产地的检验检疫机构报检，或向进口商品的目的地或使用地检验检疫机构报检，凭其签发的《出境货物通关单》或《入境货物通关单》向海关报关。所以，有的进出口商品需进行两次报检，有的只需报检一次即可。
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报检之免验商品
适用范围
列入必须实施检验的进出口商品目录的进出口商品。
但有些进出口商品除外：
1、食品、动植物及其产品；
2、危险品及危险品包装；
3、波动大或者散装运输的商品；
4、需出具检验检疫证书或者依据检验检疫证书所列重量、数量、等计价结汇的商品。
管理机构
1、质检总局统一管理进出口商品免验工作，负责对申请免验生产企业的考核、审查批准和监督管理。
2、各地出入境检验检疫机构负责所辖地区内申请免验生产企业的初审和监督管理。
企业申请的条件
需符合进出口商量应当长期稳定、有自己的、符合《进出口商品免验审查条件》的要求等条件。
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