磁分离离心管中的洗脱物通过离心分离作用，使颗粒物沉淀在离心管底部，同时去掉离心管中的上清液。将离心后的含有卵囊和孢囊的沉淀物用纯水混匀，并向其中加入Dynal公司的磁分离试剂（Dynabeads GC-Combo试剂盒）进行磁分离。具体做法是：首先用带有（抗隐孢子虫和贾第鞭毛虫）的特殊磁珠捕获沉淀物的卵囊和孢囊；其次通过Dynal公司的MPC-S磁粒浓缩器将捕获有卵囊和孢囊的磁珠
