疾病机制研究：例如，研究不同基因或信号通路对骨骼的数量或质量的影响，疾病状态对骨骼发育/修复的影响，评价高脂血症对心脏瓣膜钙化的影响，细胞1因子对骨折后组织修复时血管生长的影响，等等。
新药开发：例如，研究新的骨质疏松药1物及疗1效评价， MicroCT 已经称为一种重要的临床前检测技术。
其他：微型器件的质检相探伤，建筑材料内部孔隙度、连通度和渗透性分析，珠宝的真伪识别和佳切割方案设计，以及化石结构分析等。
Micro PET/CT成像:4只健康鸽子(雌性)经翼状静脉注射15 MBq 68Ga-HZ20，动态成像40 min，观察探针在体内的动态分布。图像采集时间分别为30 min、40 min和60 min， PET单次扫描时间为600 s。使用Avator软件显示图像，勾画出主要感兴趣的区域，记录勾画区域的标准摄取值，计算不同SUVmax的动态变化。在60 min成像结束时，获得主要进行体外成像。
在啮齿动物中，BAT（Brown Adie Tissue，棕色脂肪）是一个新陈代谢组织。不同于白色脂肪，棕色脂肪因含有丰富的血管和大量的线粒体，而呈现棕红色的外观，可以在寒冷或饥饿环境下分解线粒体、为生物体提供能量。长久以来，棕色脂肪被认为只存在于小型哺乳动物和婴幼儿中，而近期的研究发现，棕色脂肪同样存在于成人体内，显微CT尾椎，并在能量平衡调节方面发挥重要的功能。由此，棕色脂肪在能量代谢相关疾病如肥胖、Ⅱ型以及代谢紊乱等领域显示出巨大的应用潜能，关于棕色脂肪的功能和应用也迅速成为一个新的研究热点
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