这一原理对于检测一个特异的mRNA在某一种生物体，或者某些组织切片、单个细胞里具体表达位置非常有用。该技术早应用于60年代末期，由于核酸分子杂交的特异性高，并可定位，因此该技术已被广泛应用，例如与细胞内RNA进行杂交以观察该组织细胞中特定基因表达水平。原位杂交能在成分复杂的组织中进行单一细胞的研究而不受同一组织中其他成分的影响，因此对于那些细胞数量少且散在于其他组织中的细胞内DNA或RNA研究更为方便；同时由于原位杂交不需要从组织中提取核酸，对于组织中含量极低的靶序列有极高的敏感性，并可完整地保持组织与细胞的形态，更能准确地反映出组织细胞的相互关系及功能状态。
原位杂交是一项非常重要的生物技术，可以用于研究基因表达和调控，荧光原位杂交，检测基因变异和染色体异常，监测细胞生长和凋亡，以及识别特定的细胞类型或组织。然而，它需要特殊的操作技术和设备，以及严格的对照实验才能获得可靠的结果。
原位杂交是一项非常重要的生物技术，可以用于研究基因表达和调控，检测基因变异和染色体异常，监测细胞生长和凋亡，以及识别特定的细胞类型或组织。然而，它需要特殊的操作技术和设备，以及严格的对照实验才能获得可靠的结果。
原位杂交技术可以应用于以下场景：
组织中病毒DNA/RNA的检测和定位。例如，可以用于检测EB病毒mRNA、人类状瘤病毒和巨细胞病毒DNA等。
癌基因、抑癌基因及其他各种功能基因在转录水平的表达及其变化的检测。
检测染色体的变化，如染色体数量异常和染色体易位等。
在植物基因组研究中的应用。例如，通过与特定基因序列的探针进行杂交，可以在植物染色体上定位到目标基因的位置，进而构建遗传图谱，为植物育种和基因组研究提供基础数据。
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