分子标记仪器是种子进行分子标记试验时所需的仪器，在作物育种工作中有着广泛的应用。我们都知道作物育种的目标之一是改良现有品种、创造新品种，使之更符合人类生产和生活的需要。传统的育种方式具有一定的盲目性和机遇性。而随着遗传学的发展，遗传标记经历了形态学标记、细胞学标记、生化标记和分子标记等几个阶段，特别是分子标记的出现和发展，为作物育种带来了一定的契机，那分子标记究竟凭借什么优势能得到种子行业的重视呢？
与形态标记、细胞标记和生化标记等遗传标记相比，分子标记具有以下优点:
1.数量极多,可遍及整个基因组；
2.不影响目标性状的表达,与不良性状无必然的连锁遗传现象；
3.直接以DNA的形式表现,不受组织类别、发育时期、环境条件等干扰；
4.多态高。
因此，在作物生产种质资源鉴定和管理、基因图谱的构建、基因的标记和辅助育种的研究中应用分子标记仪器对其进行分子标记试验，不仅为作物育种注入了前所未有的活力，而且通过分子标记仪器进行试验可以加快分析速度、降低成本，获取更大的信息量，使分子标记在作物育种上得到广泛的应用。
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