地下水中常含有过量的铁和锰，而长期饮用含铁、含锰高的水对人体不利。水中含铁较高时，水有铁腥味，影响水的口味，作为造纸、纺织、印染、化工和皮革等生产用水，会降低产量：洗涤衣物会出现黄色或棕黄色斑渍：铁质沉淀物 会滋长铁细菌，阻塞管道，有时会出现红水。而含锰量较高的水所发生的问题与含铁量较高的情况相类似，并且在工业领域中，水中的铁、锰含量过高对设备具有一定的腐蚀从而缩短设备的使用寿命。根据我国生活饮用水质标准规定，凡是生活饮用水中铁含量大于0.3毫克／升，锰含量大于0.1毫克／升的必须进行净化处理。除铁除锰设备主要应用于地下水高铁，高锰地区经处理后的水符合饮用水标准。
