电子除垢仪，是通过高频电磁场、高压静电或低压电场的作用，使溶解在水中的正负离子（垢分子）被水分子包围，通过磁场、电场作用，降低离子间引力，减少有效碰撞次数，使带电离子结晶习性发生改变，不易发生化学反应。由原来易吸咐在容器表面的斜方晶系晶体，变成不易吸附的三斜晶系的针装晶体，从而在管壁上无法结垢，达到防垢的目的。
由于水分子在磁场、电场的作用下减弱了垢盐离子的结合，使垢盐离子形成开垢表面，成为水合离子进入水中，使受热炉壁、管壁上原来的水垢逐渐软化、疏松、自行脱落，起到除垢的作用。
水中的细菌、藻类细胞因高频电磁场、电场的作用，使细胞内原生质产生电离，影响细胞的正常代谢，导致菌藻死亡，起到杀菌、灭藻的作用。
