进出口货物报检流程大致可分为三步：
1.报检申请（报检人提供外贸合同、、提单、装箱单、等单证；实施安全质量许可、卫生检疫注册的应提交有关证明文件复印件，并在报检单上注名文件号）；
2.报检（将申请的相关信息录入CIQ2000系统，并将相关单证递交检验检疫局检务部门受理）；
3.施检部门施检（施检部门接受单据、确认、检验、结果登记、拟制证稿、审核签字）；
签发证书（检务部门对施检部门拟稿审核，并签发证书）。
入境货物的检验检疫工作程序可以分为：申请报检、受理报检、办理通关、实施检验检疫、放行
1）法定检验检疫入境货物的货主或其代理人首先向卸货口岸或到达站的出入境检验检疫机构申请报检。
2）检验检疫机构受理报检，转施检部门签署意见，计收费。
3）对来自疫区的、可能传播、动植物疫情的入境货物交通工具或运输包装实施必要的检疫、消毒、卫生除害处理后，签发《入境货物通关单》（入境废物、活动物等除外）供报检人办理海关的通关手续；
4）货物通关后，入境货物的货主或其代理人需在检验检疫机构规定的时间和地点到的检验检疫机构联系对货物实施检验检疫。
5）经检验检疫合格的入境货物签发《入境货物检验检疫证明》放行，经检验检疫不合格的货物签发检验检疫处理通知书，需要索赔的签发检验检疫证书。
报检之免验商品
适用范围
列入必须实施检验的进出口商品目录的进出口商品。
但有些进出口商品除外：
1、食品、动植物及其产品；
2、危险品及危险品包装；
3、波动大或者散装运输的商品；
4、需出具检验检疫证书或者依据检验检疫证书所列重量、数量、等计价结汇的商品。
管理机构
1、质检总局统一管理进出口商品免验工作，负责对申请免验生产企业的考核、审查批准和监督管理。
2、各地出入境检验检疫机构负责所辖地区内申请免验生产企业的初审和监督管理。
企业申请的条件
需符合进出口商量应当长期稳定、有自己的、符合《进出口商品免验审查条件》的要求等条件。
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报检入境
入境报检的要求
入境货物应入境前或入境时向入境口岸、的或到达站的检验检疫机构办理报检手续；入境的运输工具及人员应在入境前或入境时申报。
入境报检时，姐告报关报检，应填写入境货物报检单，并提供合同、发飘、提单等有关单证。
下列情况还应按要求提供有关文件：
（1）凡实施产品强制性认证、卫生注册、或其它需审批审核的货物，应提供有关证明。
（2）实施检验的，还应提供国外证书或书、产品使用说明书及有关标准和技术资料；凭样成交的，须加附成交样品；以品级或公量计价结算的，应同时申请重量鉴定。
（3）报检入境废物时，应提供签发的《进口废物批准证书》和经认可的检验机构签发的装运前检验合格证书，以及深圳检验检疫局各分支机构签发的《入/出境废旧物品检验检疫预申报证》等。
（4）申请残损鉴定的，还应提供理货残损单、铁路商务记录、空运事故记录或海事报告等证明货损情况的有关单证。
（5）申请重（数）量鉴定的，还应提供重（数）量明细单，理货清单等。
（6）货物经收、用货部门验收或其它单位检测的，应随附验收报告或检测结果以及重量明细单等。
（7）入境的动植物及其产品，需按规定办理检疫审批手续的，姐告报关报检代理，应提供有效《进境动植物检疫许可证》和输出国出具的检疫证书正本（半制动物皮张、远洋捕捞的海产品除外）；《进境动植物检疫许可证》第二联须经深圳检验检疫局动检处或植检处审核备案。
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