洁净室系利用HEPA、ULPA过滤空气，其尘埃的收集率达99。97~99。99995%之多，因此经过此过滤器过滤的空气可说十分干净。然而洁净室内除了人以外，尚有机器等之发尘源，这些发生的尘埃一旦扩散，即无法保持洁净空间，因此必须利用气流将发生的尘埃迅速排出室外。当洁净室内相对湿度精度要求≤±10%时好不采用。而采用喷干蒸汽和电热（电极）式加湿的方法。在净化工程的施工过程中，有必要随时清理房间内的灰尘，并清楚地记录天花板和墙壁内部等隐蔽空间。
净化工程的设计中的注意事项：划分和布置空调净化和排风系统，选择合理的空气净化通风设备。设计净化系统组织的原则是相邻二级过滤器的效率不能太接近，也不能相差太大。一般采用初效、中效、亚(或)三级过滤器。也可分四级，增加一级过滤器。排风系统有一般排风系统、有机气体排风系统、酸性气体排风系统、碱性气体排风系统等，净化车间设计时，要根据实际情况选择。
GMP净化工程注意事项：设备。工厂的所有设备和用具的设计，采用的材料和制作工艺，应便于充分的清洗和适当的维护。这些设备和用具的设计、制造和使用，应能防止食品中掺杂污染源。接触食物的表面应耐腐蚀，它们应采用无的材料制成，能经受侵蚀作用。接触食物的表面的接缝应平滑，无菌净化车间，而且维护得当，能尽量减少食物颗粒、脏物及有机物的堆积，从而将微生物生长繁殖的机会降低到小限度。食品加工、处理区域内不与食品接触的设备应结构合理，便于保持清洁卫生。食品的存放、输送和加工系统的设计结构应能使其保持良好的卫生状态。
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