CT系统采集到图像是2D的投影图像，如果要看到空间的3D结构，必须通过重建的手段来还原。重建是一种3D图像的重塑手段，重建的尺寸大小在算法上可以人为地去设置。理论上，重建尺寸设置得越小，能得到越高清的图像，但是如果将重建尺寸设置的小于系统的空间分辨率，并没有意义，也不能进一步提高图像质量，牙周炎小动物CT，只是将图像增大。所以实际上重建尺寸根据系统的分辨率以及样本扫描目的着情设置就好，比如离体样本时重建尺寸偏小设置，样本时重建尺寸可偏大设置。
越来越多的科研人员在使用大鼠的颌骨作为牙1科相关领域的研究模型。牙槽骨是颌骨的一部分，包围着牙齿，是牙齿重要的支撑组织。牙槽骨也是牙周系统或骨骼系统中具活力的组织。牙槽骨的重塑不仅与局部因素（牙齿萌出、咬合功能、牙齿脱落和正畸牙齿移动）有关，还与还与性激1素和营养等因素有关。这些生理和病理特征突出了牙槽骨研究的必要性。通过显微CT对大鼠的颌骨内部结构进行精细观察并且定量分析，可为形态学观察和疾病研究提供有力的影像数据支撑
药品中物质空间分布，特别是结构复杂的物质空间分布，对释放具有特定的功能和意义。从本质上讲，传递系统的开发需要解决有效成分（API）和辅料的结构设计和空间分布控制，两者都直接关系到的质量属性和效果。目前，材料分布和药片微观结构之间的关系尚未得到充分的研究。显微CT确定的内部层次结构的复杂性可以提供对小单位递送系统中物质分布的洞察。
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