滋生根结线虫
鸡粪是根结线虫的宿营地和温床，自身携带根结线虫卵的数量为每1000克100个，鸡粪中的线虫卵极易孵化，一夜之间倍增数万，土壤中的线虫在有鸡粪的地块发生率提高500%倍以上。
线虫对化学药剂有极为敏感的趋避性，施药后线虫会迅速转移到地下50公分-1.5米的深处躲避，所以很难治。尤其对于3年以上老棚，根结线虫是致命的隐患之一。
鸡粪里还含
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滋生根结线虫
鸡粪是根结线虫的宿营地和温床，自身携带根结线虫卵的数量为每1000克100个，鸡粪中的线虫卵极易孵化，一夜之间倍增数万，土壤中的线虫在有鸡粪的地块发生率提高500%倍以上。
线虫对化学药剂有极为敏感的趋避性，施药后线虫会迅速转移到地下50公分-1.5米的深处躲避，所以很难治。尤其对于3年以上老棚，根结线虫是致命的隐患之一。
鸡粪里还含有含氮非蛋白化合物，它们以尿酸和氨化物形态存在，适用于反刍动物。鸡粪中的各种氨基酸也比较平衡，每千克干鸡粪中含有赖氨酸5.4克、胱氨酸1.8克、苏氨酸5.3克，均超过玉米、高粱、豆饼、棉籽等的含量。此外，还含有B族维生素，特别是维生素B12，以及各种微量元素，1000只鸡1年的粪便相当于25吨豌豆中粗蛋白的含量。每只鸡每年平均产鲜粪41.4千克，每万只鸡平均每年产鲜粪414吨。
多施有机肥虽然可以提高大棚内的二氧化碳浓度，如果大棚内作物生长繁茂，叶面积指数较大，光合作用对二氧化碳消耗量大，加之大棚处于密闭状态，空气中二氧化碳含量常来不及依靠土壤释放的二氧化碳进行补充。所以，多施有机肥代替人工补施二氧化碳有好处。要想为了获得大棚蔬菜高产，因时、因菜适量人工补施二氧化碳还是十分必要的。
鸡粪含粗蛋白约28%、纯蛋白13%，总氨基酸8%，且各种氨基酸比较平衡，此外，还含有丰富的B族维生素和多种微量元素。所以,鸡粪是廉价的低能蛋白饲料。
但是鸡粪不被处理或腐熟而直接施用到作物上，则存在很大的害处及隐患。直接施在土壤中，在合适条件下发酵并产生大量的热量，烧毁作物根系。同时鸡粪本身带有大量病菌，给作物带来病害隐患。因此须将鸡粪进行无害化处理并完全腐熟后才能施用于作物。
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