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益生菌也可以T细胞和NK细胞(Natural Killer Cell，自然杀伤细胞)，两者都能起到细胞杀伤作用，阻断细胞。

还有一些研究显示某些益生菌能促进脾细胞增殖，重量增加，使功能增强。以及能产生其它如白细胞介素-1，白细胞介素-10（IL-1，IL-10）或干扰素。

在体液中，另一种细胞B细胞受到益生菌刺激，产生的不同类型球蛋白（IgA）增多，然后结合一个保护球蛋白的分泌小体成为sIgA，再由肠黏膜上皮细胞释放，抑 制病原微生物的定植，应答功能增强。

益生菌对过敏症状的改善也是系统平衡的体现。

过敏是人体的系统产生紊乱、失调的情况，是一种理反应。当外来成分、生物体激发过敏体质人员的系统时，机体便会生成较多的球蛋白，散出组织胺从而导致身体过敏。益生菌法是一种如今盛行帮辅诊治身体过敏的良好措施，通过该措施可有效平衡蛋白，改善病情。

乳酸菌可有效增强巨噬细胞的活，且阻碍的滋生及成长。益生菌可有效加体肠道系统中β—葡糖酶、偶氮还原酶等一些酶的活，这些酶很可能与致癌物质的生成相关联。还能效遏制有害菌的滋生与成长，即便胆盐存在于此，致癌概率也会减小不少。

　 通过一系列人体肠道内实验，科学家发现，许多人的消化道阻止了标准益生菌对其进行“殖民”。此外，服用益生菌平衡副作用，可能会延缓正常肠道细菌和基因表达回归初始状态。两篇相关于美国东部时间9月6日发表在《细胞》杂志上。

　　“人们十分青睐益生菌，尽管针对益生菌的文献是非常有争议的。”通讯作者、以色列魏茨曼科学研究所学家Eran Elinav在接受《科学报》记者采访时表示，令人惊讶的是，研究显示许多健康志愿者对益生菌有抵抗力，这些细菌不能“占领”他们的胃肠道。维持肠道菌群结构平衡肠道不仅是机体正常的组成部分，参与机体重要的生理活动，同时，肠道中还存在复杂的肠道菌群，它们对宿主的生长、发育和健康等方面发挥着重要的功能。