试剂准备
1X测定/裂解缓冲液:短暂混合5X储备液,并在去离子水中稀释至1X。 在使用前,添加蛋白酶抑制l剂,例如1 mM PMSF,10 μg / mL亮肽素和10 μg / mL抑肽酶。
1.将细胞(一块10厘米长的平板,约107个细胞)培养至约80-90%汇合。根据需要用活化剂或抑制l剂刺激细胞。
2.吸出培养基,并用
Rab7 蛋白
试剂准备
1X测定/裂解缓冲液:短暂混合5X储备液,并在去离子水中稀释至1X。 在使用前,添加蛋白酶抑制l剂,例如1 mM PMSF,10 μg / mL亮肽素和10 μg / mL抑肽酶。
1.将细胞(一块10厘米长的平板,约107个细胞)培养至约80-90%汇合。根据需要用活化剂或抑制l剂刺激细胞。
2.吸出培养基,并用冰冷的PBS洗涤两次。
3.完全除去PBS洗涤液,然后向细胞中加入冰冷的1X分析/裂解缓冲液(每10 cm组织培养板0.5-1 mL)。
4.将培养板放在冰上10-20分钟。
5.用刮板将其从平板上取下。
6.将裂解物转移至适当大小的试管中,并置于冰上。
7.如果发生核裂解,则细胞裂解液可能变得非常粘稠,难以移液。如果发生这种情况,可将裂解液通过27号注l射器针头3-4次以剪切基因组DNA。
8.通过离心10分钟(在4°C下为12,000 x g)清除裂解物。
9.收集上清液并将样品(约1-2 mg的总蛋白)存储在冰上以立即使用,或速冻并存储在-70°C以便将来使用。
阳性对照和阴性对照的体外GTPγS/ GDP蛋白质上样量
注意:体内细胞刺激将激l活可用Arf 6的大约10%,而体外GTPγS蛋白负载将激l活Arf 6的将近90%。
1,将0.5 ml每种细胞提取物等分到两个微量离心管中(或使用1 μg纯化的Arf 6
蛋白)。
2,向每个试管中加入20 μl 0.5 M EDTA(终浓度为20 mM)。
3,将5 μl 100 XGTPγS(至100 μM,终浓度)加到一个试管中(阳性对照)。
4,在第二个试管中加入5 μl 100 X GDP(至1 mM,终浓度)(阴性对照)。
5,在搅拌下将试管在30°C孵育30分钟。
6,通过将试管放在冰上并添加32.5 μl 1 M MgCl2(至60 mM,终浓度)来停止加载。
测定步骤
I.主动Arf 6下拉分析
1.将0.5 – 1 mL细胞裂解液等分到微量离心管中。
2.使用1X分析/裂解缓冲液将每个样品的体积调整为1 mL。
3.在管中加入1 μl抗活性Arf 6单克l隆抗l体。
4.通过涡旋或滴定重悬蛋白A / G琼脂糖珠浆。
5.向每个管中添加20 μL重悬浮的珠浆。
6.轻轻搅拌将试管在4°C下孵育1小时。
7.通过以5,000 x g离心1分钟来沉淀小珠。
8.吸出并丢弃上清液,确保不要干扰/除去珠粒。
9.用0.5 mL的1X Assay / Lysis Buffer洗涤磁珠3次,每次离心并吸出。
10.后一次洗涤后,将珠粒沉淀并小心除去所有上清液。
11.将磁珠沉淀重悬于20 μL 2X还原SDS-PAGE样品缓冲液中。
12.将每个样品煮沸5分钟。
13.以5,000 x g的速度离心每个样品10秒钟。
电泳和转膜
1. 取15ul样品/孔上样17%配体胶。
2. 按照制造商的说明进行SDS-PAGE。
3. 按照制造商的说明将凝胶蛋白转到PVDF或硝化纤l维素膜。
免l疫印迹反应和检测(所有步骤都是在室温下进行,并不断搅拌)
1. 将PVDF膜浸入甲l醇15s,然后在室温放置5 min晾干。
注意:如果使用的是硝化纤l维素膜,此步省略。
2. 封闭:用TBST缓冲液配制5%的脱脂牛奶或者3%BSA在室温下孵育1H进行封闭,并需要恒定振荡。
3. 孵育一抗:用TBST缓冲液配制的5%脱脂牛奶或3%BSA稀释特异性识别Cdc42活性构象的兔多克l隆抗l体(稀释比例为1:50-1:1000,主要根据样品中含有的Cdc42蛋白的量),室温下孵育1-2小时,或者4°C条件下过夜孵育。
4. 用TBST缓冲液洗涤膜三次/5min。
5. 孵育二抗:(例如羊抗兔IgG-HRP),用TBST缓冲液配制的5%脱脂牛奶或3%BSA按1:1000稀释比例稀释后使用,室温下孵育1小时并恒定振荡。
6. 用TBST缓冲液洗涤膜三次/5min。
7. 使用实验者所选择的检测方法进行显色如ECL显色法。
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