试验结果表明，生物有机肥可有效促进果树的生长发育。研究表明，设施桃树上施用生物有机肥后，显着提高了土壤温度，10厘米根际土壤温度平均升高2.2℃；促进了土壤表层根系的发生与生长，细根数量比对照增加1.5倍；明显提高了设施内桃的坐果率，比对照提高45.6%；成熟期提前，比对照早熟10-12天。在设施草莓上施用生物有机肥后，植株生长明显改善，所有指标均高于对照，根呼吸强度和根系生长
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试验结果表明，生物有机肥可有效促进果树的生长发育。研究表明，设施桃树上施用生物有机肥后，显着提高了土壤温度，10厘米根际土壤温度平均升高2.2℃；促进了土壤表层根系的发生与生长，细根数量比对照增加1.5倍；明显提高了设施内桃的坐果率，比对照提高45.6%；成熟期提前，比对照早熟10-12天。在设施草莓上施用生物有机肥后，植株生长明显改善，所有指标均高于对照，根呼吸强度和根系生长点数分别增加2.5倍和1.2倍，新根总表面积和根冠比分别增加117.3%和44.9%，叶片光合强度提高70%以上。
土壤是一个很重要的自然资源。沈其荣认为土壤基础地力是实现作物产量潜力的关键因素， 就每千克化肥在不同作物上的平均增产效果而言，1975 年为25 kg 谷粒/kg 化肥、15 kg 油料/kg 化肥、10 kg 棉花/kg 化肥；2008 年为8~9 kg 谷粒/kg化肥、6～7 kg 油料/kg 化肥、5～6 kg 棉花/kg 化肥。化肥报酬的急剧下降表明，随着化肥的长期使用，土壤的基础地力正在逐渐减弱， 而土壤基础地力的减弱已成为影响农业可持续发展和农作物高产、稳产的重要限制因素。
微生物肥料中的微生物在高温干旱条件下，生存和繁衍就会遭到影响，不能发挥良好的作用。因而，应选择阴天或晴天的黄昏施用，并分离盖土、盖粪、浇水等措施，防止微生物肥料受阳光直射或因水分缺乏而难以发挥作用、防止与未腐熟的农家肥混用。与未腐熟的有机肥混用，会因高温杀掉微生物，影响微生物肥料的发挥。
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