研究表明，发酵饲料的低pH 以及高浓度的乳酸含量可以有效抑制肠、沙门氏菌等病原菌在饲料中生长繁殖。饲料在发酵过程中，大肠和沙门氏菌能够使赖氨酸等合成氨基酸降解，生成1，5-二氨基戊烷（尸胺），人工接种乳酸菌，通过控制发酵饲料的乳酸含量和pH，可以有效保护赖氨酸等合成氨基酸不被分解，有利于发酵饲料长期安全存储。本研究测得的发酵全价饲料中既没有大肠检出，赖氨酸含量也没有显著
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研究表明，发酵饲料的低pH 以及高浓度的乳酸含量可以有效抑制肠、沙门氏菌等病原菌在饲料中生长繁殖。饲料在发酵过程中，大肠和沙门氏菌能够使赖氨酸等合成氨基酸降解，生成1，5-二氨基戊烷（尸胺），人工接种乳酸菌，通过控制发酵饲料的乳酸含量和pH，可以有效保护赖氨酸等合成氨基酸不被分解，有利于发酵饲料长期安全存储。本研究测得的发酵全价饲料中既没有大肠检出，赖氨酸含量也没有显著改变，保证了发酵全价饲料的安全性。
玉米秸秆饲料能够显著提高家畜机体的能力，并能够有效预防肠道疾病。采用微生物处理方法可以有效减少氨的产生，避免发生氨，同时能够有效减少粪便污染，提高家畜的饲养环境，进而降低疾病的发生率。采用微生物饲料生产的饲料能够显著改善家畜的肉质，并提高家畜的奶质，具有重要的经济效益价值。饲料经过发酵后蛋白质被分解为更易被动物体消化吸收的小分子、寡肽，纤维素、果胶被降解为单糖和寡糖，同时代谢产生的多种消化酶、氨基酸、维生素、抑菌物质、增强因子以及其它一些菌体蛋白，作为营养物质被动物体吸收利用，显著提高饲料的营养水平和饲料利用率，从而提高动物体的各项生产指标。
玉米秸秆发酵得用发酵剂，发酵剂中一般含有以光合菌、乳酸菌、酵母菌为主体的多种有益微生物、酶及代谢产物等。能够适应青贮、糠粃、米糠、次粉、鱼粉、饼粕等制作发酵饲料全过程。玉米秸秆的微生物发酵技术必须要注意以下几点问题，点，玉米秸秆的微贮过程必须要注意保持密封，物料必须要进行压实，同时不能出现加干层。第二点，微生物菌液应该保持喷洒均匀，同时水分应该控制在 50%到60%之间。第三点，霉变的农作物秸秆不宜作微贮饲料。
挖窖选择土质坚实，地势高燥，背风向阳，雨水不易冲淹的地方建造青贮窖。窖形一般有圆形与长方形之分，窖壁平直光滑，不透水，不透气。窖的宽度一般应小于深度，较好的比例是1：1．5-2，利于原料本身重量将其压实，并能降低损耗量。窖的大小应根据青贮数量及养畜头数来决定，圆形的一般直径在1．7-3米之间，深度以3- 4米为宜，底部要呈锅底形。规模养畜场宜采用长方形窖，宽度在1．7-3米之间，深度以2．3-3．3米为宜，长度随青贮数量而定。长方形窖的边角应呈圆形，以利原料的下降和压实。为减少青贮料的损失，窖底和四周应铺一层塑料薄膜。
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