试验结果表明，生物有机肥可有效促进果树的生长发育。研究表明，设施桃树上施用生物有机肥后，显着提高了土壤温度，10厘米根际土壤温度平均升高2.2℃；促进了土壤表层根系的发生与生长，细根数量比对照增加1.5倍；明显提高了设施内桃的坐果率，比对照提高45.6%；成熟期提前，比对照早熟10-12天。在设施草莓上施用生物有机肥后，植株生长明显改善，所有指标均高于对照，根呼吸强度和根系生长
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试验结果表明，生物有机肥可有效促进果树的生长发育。研究表明，设施桃树上施用生物有机肥后，显着提高了土壤温度，10厘米根际土壤温度平均升高2.2℃；促进了土壤表层根系的发生与生长，细根数量比对照增加1.5倍；明显提高了设施内桃的坐果率，比对照提高45.6%；成熟期提前，比对照早熟10-12天。在设施草莓上施用生物有机肥后，植株生长明显改善，所有指标均高于对照，根呼吸强度和根系生长点数分别增加2.5倍和1.2倍，新根总表面积和根冠比分别增加117.3%和44.9%，叶片光合强度提高70%以上。
作物施用生物有机肥后， 其中的发酵菌和功能菌大量繁殖， 对改良土壤、促进作物生长、减轻作物病害具有显著效果。主要原因在于：一、肥料中的有益微生物会在土壤中大量定殖形成优势种群， 抑制其他有害微生物的生长繁殖，甚至对部分病原微生物产生拮抗作用，以减少其侵染作物根际的机会。
二、功能菌发挥功效增进土壤肥力，比如施用含固氮微生物的肥料，可以增加土壤中的氮素来源；施用含解磷、解钾微生物的肥料，其中的微生物可以将土壤中难溶的磷、钾分解出来，以便作物吸收利用。
三、肥料中的许多微生物菌在生长繁殖过程中会产生对作物有益的代谢产物，能够刺激作物生长，增强作物的抗病抗逆能力。
国内外大量研究表明， 施用生物有机肥可以有效防治土传病害。利用对枯萎病有拮抗作用的多黏类芽孢菌制成的生物有机肥， 其田间防治效果达到73％。由枯草芽孢菌Ⅱ-36 和Ⅰ-23 分别制成的茄子生物肥BIO-36 和BIO-23， 经盆栽试验验证，这两种肥料均能有效抑制茄子青枯病， 防病率分别为96％和91％。目前，生物有机肥在防治蔬菜、水果、烟草等作物土传病害方面效果十分显著， 是防治土传病害的一条重要且有效的生态调控防病途径。
有机肥为农作物提供营养物质，可以改善泥土的构造及提供足够水费，氧气和营养，而营养土又称腐殖土，是由有机固体物质，经常微生物发酵腐熟而成的，质轻疏松，透水性能好、多孔隙、富含有机质，调理土壤中的水分，氧气，温度，营养。到达养土养根的效果。同时还能够改进土壤机构有机肥和营养土还可配合运用，将营养土作为基底，混合有机肥运用效果更佳。
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