武汉迈斯普生物科技有限公司是一家从事生物医学技术服务、技术咨询及产品开发的生物技术服务企业。公司坐落于武汉光谷,由3位归国博士创办。但是其实目前已经有非常多的软件和网站可以直接根据蛋白的序列,预测出所属的亚细胞位置。公司长期致力于建立并完善多项基础生物技术服务平台。现凭借自身技术特色,依托光谷生物城技术产业优势,面向提供的生物技术服务。
GaMYB2 在洋
蛋白亚细胞定位技术服务
武汉迈斯普生物科技有限公司是一家从事生物医学技术服务、技术咨询及产品开发的生物技术服务企业。公司坐落于武汉光谷,由3位归国博士创办。但是其实目前已经有非常多的软件和网站可以直接根据蛋白的序列,预测出所属的亚细胞位置。公司长期致力于建立并完善多项基础生物技术服务平台。现凭借自身技术特色,依托光谷生物城技术产业优势,面向提供的生物技术服务。
GaMYB2 在洋葱表皮细胞中的瞬时表达分析:采用基因枪轰击的方法,用包裹质粒的金粉对洋葱表皮进行轰击,暗培养过夜后,在激光共聚焦显微镜下进行观察,从图A 中可以看出对照GFP空载体在整个洋葱细胞均能看到绿色荧光,为组成型表达;从图B 中发现GaMYB2-GFP 的融合表达载体只能在细胞核中能看到绿色荧光,这进一步证明该蛋白不具有跨膜蛋白结构,定位在细胞核中,具有转录因子的一般特征。这种亚细胞地图能用于改进现有的蛋白质-蛋白质相互作用网络,也是解析人类细胞高度复杂结构的重要资源。
蛋白质是生命活动的主要承担者,也是组成人体一切细胞、组织的重要成分。研究表明,所有蛋白质有对应的亚细胞器,不同功能的蛋白质只有存在于特定的亚细胞器,才能正常发挥其作用。磷酸烯醇型酸转变成酸时又产生1分子ATP,此反应由酸激酶催化。因而寻找一种简单的方法对蛋白质亚细胞器进行定位,即获取其特定的亚细胞区间,对了解蛋白质的功能和性质,研究蛋白质之间的相互作用具有重要意义。随着高通量测序时代的来临,大部分生物数据需要通过理化实验对其结构及功能进行注释,传统标注方法如细胞分馏、电子显微镜和荧光显微镜等,成本较高,且耗时费力,借助的计算机技术,基于统计预测或理论计算的方法从海量数据中挖掘出有效信息已成为了当今时代的迫切需要。
蛋白质亚细胞定位的工具现在已经很了,但是基本的理论近年来没有重大突破,预测结果也需要实验验证。比较好的工具有ProteomeAnalyst (个人感觉较准的,但是有些蛋白预测不出来),pTarget,WolfPsort,Nucleo(针对核定位),TargetP。可检索细胞器及其子结构蛋白组、单一或者多重定位的蛋白数据、不同细胞之间差异表达蛋白等等信息。不同工具特性也不太一样。可以参考一下工具的发表时间和发表杂志的分量,然后把各种工具的结果综合一下。
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