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发酵饲料的原料很多，按来源可分为：饼粕类，粮食加工厂的副产品类，微生物发酵加工厂的下脚料类，菌菇生产的基料，果蔬加工厂的下脚料类，植物的根、茎、叶类，畜禽屠宰场的下脚料类，水产品加工厂的下脚料类，薯渣类等。随着发酵饲料技术的日渐成熟及工艺设备的不断完善，更多的自然界产生的有机物及更多的加工副产物将成
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发酵饲料的原料很多，按来源可分为：饼粕类，粮食加工厂的副产品类，微生物发酵加工厂的下脚料类，菌菇生产的基料，果蔬加工厂的下脚料类，植物的根、茎、叶类，畜禽屠宰场的下脚料类，水产品加工厂的下脚料类，薯渣类等。随着发酵饲料技术的日渐成熟及工艺设备的不断完善，更多的自然界产生的有机物及更多的加工副产物将成为发酵饲料的原料，利用率得到进一步的提高。
发酵饲料按照比例添加到全价料中，带来的非常直观的效益主要体现在：降低70%的用药成本，也就是说减少了至少70%的疾病发生；提高饲料利用率15%以上，尤其是过料现象，过了浪费了非常多的一部分的玉米豆粕，发酵产品提高了饲料的利用率；养殖环境质量提升了，应激减少，成活率大大提升。综合计算，可以提升至少10%的经济效益。
发酵饲料的生产整个流程是：菌的扩繁、菌与底物原料的混合、厌氧包装、成品出库。这其中牵扯到的必备的设备有菌扩繁罐、混合机、热封口机，这三种是缺一不可的。首先一个菌扩繁罐对一般的小型客户而言尤其是养殖户自己生产用的情况下，可有可无，因为也可以直接购买成品的菌生产，但是对于饲料厂必须得上这个设备，可以降低一部分的成本。菌扩繁罐，简单的说就是把原始菌进行扩繁，有由原来的十公斤扩繁成500公斤。
饲料在发酵的过程中，微生物区系平衡被打破后，益生菌在特定情况下有可能会转变为病原菌，如乳酸杆引起的临床生病。因此发酵饲料的使用应充分考虑动物、消费者以及环境等因素安全方面的问题，经过严格的科学试验确认其无害后才能推广应用。微生物发酵饲料中的大部分有益菌是活菌，而抗生具有杀菌作用，因此二者也不能同时使用。
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