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发酵饲料的原料很多，按来源可分为：饼粕类，粮食加工厂的副产品类，微生物发酵加工厂的下脚料类，菌菇生产的基料，果蔬加工厂的下脚料类，植物的根、茎、叶类，畜禽屠宰场的下脚料类，水产品加工厂的下脚料类，薯渣类等。随着发酵饲料技术的日渐成熟及工艺设备的不断完善，更多的自然界产生的有机物及更多的加工副产物将成为发酵饲料的原料，利用率得到进一步的提高。

发酵饲料的生产整个流程是：菌的扩繁、菌与底物原料的混合、厌氧包装、成品出库。这其中牵扯到的必备的设备有菌扩繁罐、混合机、热封口机，这三种是缺一不可的。首先一个菌扩繁罐对一般的小型客户而言尤其是养殖户自己生产用的情况下，可有可无，因为也可以直接购买成品的菌生产，但是对于饲料厂必须得上这个设备，可以降低一部分的成本。菌扩繁罐，简单的说就是把原始菌进行扩繁，有由原来的十公斤扩繁成500公斤。

补充营养成分

微生物饲料添加剂中的有益菌在肠道内代谢所产生的多种氨基酸、B族维生素以及其他一些有用的代谢产物，可以作为营养物质为畜禽吸收利用。

防止有害物质的产生

微生物饲料添加剂能促进营养物质的消化吸收，因而可以减少氨和其他物质的产生。研究表明，正常微生物群构成了机体的化学屏障和生物屏障。微生物的代谢产物如、丙酸、乳酸、抗苗肽和其他活性物质等共同组成化学屏障；微生物菌群有秩序地定植于黏膜、皮肤等表面或细胞之间形成生物屏障，这些屏障可以阻止病原微生物的定植，起着占位、争夺营养的作用。

动物肠道有益微生物的功能①维持肠道微生态平衡：肠道内有益微生物在定性、 定量和定位等方面保持平衡状态， 从而维持肠道微生态平衡。有益微生物一旦平衡失调，将导致动物体生产性能下降和发病。②生物夺氧：需氧微生物，消耗肠道内的氧气，形成厌氧环境，抑制有害需氧菌和兼性的增殖，防止发病。③生物颉颃作用：有益微生物与病原微生物竞争肠黏膜上皮细胞粘附位点，形成产生颉颃作用。④增强机体功能：刺激、激发机体体液和细胞，增强机体的和抗病力。⑤产生营养物质：有益微生物产生消化酶和营养物质，参与机体新陈代谢。