免yi共沉淀(Co-IP检测)是以抗ti和抗原之间的专一性作用为基础的用于研究蛋白质相互作用的方法。当细胞在非变性条件下被裂解时,完整细胞内存在的许多蛋白质与蛋白质间的相互作用也被保留下来。当检测如转录调控因子一类的DNA结合蛋白,可用纯化蛋白,部分纯化蛋白,或核细胞抽提液。用预先固化在beads上的蛋白质A的抗ti免yi沉淀A蛋白,那么与A蛋白在体内结合的蛋白质B也能一起沉淀下来
实时定量pcr
免yi共沉淀(Co-IP检测)是以抗ti和抗原之间的专一性作用为基础的用于研究蛋白质相互作用的方法。当细胞在非变性条件下被裂解时,完整细胞内存在的许多蛋白质与蛋白质间的相互作用也被保留下来。当检测如转录调控因子一类的DNA结合蛋白,可用纯化蛋白,部分纯化蛋白,或核细胞抽提液。用预先固化在beads上的蛋白质A的抗ti免yi沉淀A蛋白,那么与A蛋白在体内结合的蛋白质B也能一起沉淀下来,再通过蛋白变性分离,对B蛋白进行检测,进而证明两者间的相互作用。

DNA测序检测
1. PCR测序反应
(1)取0.2ml的PCR管,用记号笔编号,将管插在颗粒冰中,按下表加试剂:
所加试剂测定模板管标准对照管
BigDye Mix
1μl
待测的质粒DNA
1μ 1
pGEM-3Zf (+)双链DNA
-1μ1
待测DNA的正向引物
M13(-21)引物- 1μ 1
灭菌去离子水
2μ 1
总反应体积5μ 1,不加轻矿物油或石蜡油,盖紧PCR管,用手指弹管混匀,稍离心。
(2)将PCR管置于9600或2400型PCR仪.上进行扩增。98C变性2min后进行PCR循环,
PCR循环参数为96C 10s, 50C 5s, 60°C4min, 25 个循环,扩增结束后设置4C保温。
2.乙醇法纯化PCR产物
(1) 将混合物离心,将扩增产物转移到1.5ml EP管中。
(2)加入25μ 1/乙醇混合液,充分振荡,置冰上10min以沉淀DNA。12 000r/min于
4C离心30 min,小心弃上清。
(3)加70%(V/V)的乙醇50μ 1 洗涤沉淀2次。12 000r/min 于4C离心5min,小心弃上清和
管壁的液珠,真空干燥沉淀10~ 15min。
3.电泳前测序PCR产物的处理。
(1)加入12μ 1的TSR于离心管中,剧烈振荡,让其充分溶解DNA沉淀,稍离心。
(2)将溶液转移至盖体分离的0.2ml PCR管中,稍离心。
(3)在PCR仪上进行热变性(95C 2min),冰中骤冷,待_上机。
4..上机操作按仪器操作说明书安装毛细管,进行毛细管位置的校正,人工手动灌胶和建立
运行的测序顺序文件。
5.仪器将自动进行序列分析,并可根据用户要求进行序列比较。如测序序列已知,可通过
序列比较以星号标出差异碱基处,提高工作效率。
6.测序完毕按仪器操作规程进行仪器清洗与保养。
microRNA芯片:
RNA干扰(RNA Interference, RNAi)现象是一种进化上保守的抵御转基因或外来病毒qin犯的防御机制。将含有靶基因mRNA同源互补序列的RNA(Double strand RNA, dsRNA)导入细胞后,能够特异地识别该mRNA,引起mRNA的降解,从而导致相应的功能缺失。RNAi提供了一种经济、快捷、gao效的抑制特异基因表达的技术手段,该技术已被广泛用于研究基因功能和chuan染性疾病及恶xingzhong瘤基因zhi疗领域。在逆转录酶的作用下,以病毒RNA为模板合成cDNA再通过DNA、转录、翻译等过程形成病毒颗粒。目前常用的RNA干扰手段为miRNA、 shRNA和siRNA等。
MiRNA是一类可以通过RNAi机制调节基因表达的内源性小RNA,人工miRNA与shRNA的设计原理基本相同,由于miRNA具有内源性,因此其更易产生有效的基因沉默。
技术流程:
dsRNA或pre-miRNA被导入细胞后,能够被一种特异的核酸内切酶(Dicer)识别并切割成为小片段,这些片段在RNA解旋酶的作用下解链。继之反义链在与体内一些酶(包括内切酶、外切酶、解旋酶等)结合形成RNA诱导的沉默复合物(RNA-Induced Silencing Complex,RISC),RISC与mRNA同源区进行特异性结合,若miRNA与mRNA的结合位点配对,则切割mRNA;若miRNA与mRNA的结合位点不配对,则抑制mRNA的翻译。腺相关病毒的滴度在10^12~10^13GC/ml,可以满足各类整体实验的使用要求。

Southern杂交
实验原理
Southern印迹杂交(Southern blot)是1975年由英国人southern创建,是研究DNA图谱的基本技术。Southern印迹杂交是进行基因组DNA特定序列定位的通用方法。4、聚合完成后,SYBRGreen染料与双链产物结合,定量PCR系统检测到荧光的净增量加大。一般利用琼脂糖凝胶电泳分离经限制性内切酶消化的DNAl片段,将胶上的DNA变性并在原位将单链DNAl片段转移至尼龙膜或其他固相支持物上,经干烤或者紫外线照射固定,再与相对应结构的标记探针进行杂交,用放l射自显影或酶反应显色,从而检测特定DNA分子的含量。

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