等温核酸试剂盒
核酸试剂盒是如何工作的?
病毒的基因序列被设定为检测靶点,通过对检测样本进行PCR扩增,因PCR反应模板仅为DNA,因此在进行PCR反应前,应将新型冠状病毒核酸(RNA)逆转录为DNA,使靶点的DNA序列指数级增加,每一个扩增出来的DNA序列都可以于预先加入的荧光标记探针结合,产生荧光信号,扩增出来的靶点基因越多,累积的荧光信号就越强(就好比演唱会
TwistAmp exo公司
等温核酸试剂盒
核酸试剂盒是如何工作的?
病毒的基因序列被设定为检测靶点,通过对检测样本进行PCR扩增,因PCR反应模板仅为DNA,因此在进行PCR反应前,应将新型冠状病毒核酸(RNA)逆转录为DNA,使靶点的DNA序列指数级增加,每一个扩增出来的DNA序列都可以于预先加入的荧光标记探针结合,产生荧光信号,扩增出来的靶点基因越多,累积的荧光信号就越强(就好比演唱会如果只有一个粉丝摇荧光棒很不显眼,如果大家一起摇那就嗨了)。如果样本中没有该病毒,自然也就检测不到荧光信号的增强了。
核酸试剂盒
RPA技术主要依赖于三种酶:能结合单链核酸(寡核苷酸引物)的重组酶、单链DNA结合蛋白(SSB)和链置换DNA聚合酶。这三种酶的混合物在常温下也有活性,反应温度在37°C左右。
重组酶与引物结合形成的蛋白-DNA复合物,能在双链DNA中寻找同源序列。一旦引物定位了同源序列,就会发生链交换反应形成并启动DNA合成,对模板上的目标区域进行指数式扩增。被替换的DNA链与SSB结合,防止进一步替换。在这个体系中,由两个相对的引物起始一个合成事件。整个过程进行得非常快,一般可在十分钟之内获得可检出水平的扩增产物。RPA扩增的基础体系(TwistAmp Basic)含有DNA扩增所需的所有试剂,我们只要准备好引物和模板就行。扩增结果可以通过凝胶电泳进行终点检测,产物纯化后可用于下游研究。
在这个基础体系中添入不同的酶和探针,就可以实现多样化的RPA应用。举例来说,TwistAmp exo结合了exo探针技术和核酸外切酶III,能实现数据的实时读取,就像荧光定量PCR一样。不过反应终点的扩增子总量有所减少,适合获得强荧光信号进行动力学分析,不适合终点检测(比如跑胶)。将exo探针技术、核酸外切酶III和逆转录酶结合起来,可以一步实现RNA模板的实时扩增。
“一般来说,核酸检测是目前准确的诊断方法。”有人告诉记者,核酸检测试剂盒出现假阴性,即没有发现隐藏的病毒,可能与两个方面有关。一是样品没有采集到。这一点很容易理解。例如,咽拭子采样时人比较难受,深度不够可能会采集不到含有病毒的样本。但这样的情况应该很少发生。
另一个假阴性的原因是核酸检测试剂盒的探针和引物质量有波动,特别是定量的不造成检测的不准确。换句话说,由于这一次各家核酸检测试剂盒供应商都是临时启动,有些准备不足,或是执行规定步骤不到位,导致在生产过程中不进行定位,或是酶活性不足,或是酶中含有抑制酶链反应的重金属离子等,都可能造成检测结果出现假阴性。
由新型冠状病毒(SARS-CoV-2)引起的新冠(COVID-19)正在世界范围内大规模蔓延,威胁着的公共卫生系统和人类的生命健康。目前,由于缺乏有效的措施,因此尽可能多的筛选有症状或无症状者并找到他们的接触范围是预防新冠疫情传播的有效方式。逆转录-实时定量聚合酶链式反应(RT-qPCR),因其高的灵敏度和特异性,是目前新冠检测的金标准方法。但是该方法对实验室环境、检测仪器、以及操作人员要求相对较高,因此不利于推广到需要现场即时检测(POCT)的地方,尤其是在欠发达或资源匮乏的地区。
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