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以下列出了一些色谱柱的清洗溶剂和顺序，作为参考：以正已烷(或庚烷)、和的硅胶柱依次冲洗，然后按相反的顺序冲洗，所有的溶剂必须严格脱水。可以清洗掉残留的强极性杂质，并对硅胶表面进行活化。反相柱用水、、、(或)依次冲洗，然后按反序冲洗。若下一步分析所用的流动相不含缓冲液，就可以忽略一步用水冲
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以下列出了一些色谱柱的清洗溶剂和顺序，作为参考：以正已烷(或庚烷)、和的硅胶柱依次冲洗，然后按相反的顺序冲洗，所有的溶剂必须严格脱水。可以清洗掉残留的强极性杂质，并对硅胶表面进行活化。反相柱用水、、、(或)依次冲洗，然后按反序冲洗。若下一步分析所用的流动相不含缓冲液，就可以忽略一步用水冲洗。可洗去残留的非极性杂质，多次在()冲洗时多次注射100-200μ l四氢，有助于去除强疏水性的杂质。四氢与或混合溶液可去除类脂。有时候还要注射几次二甲砜。用0.1%的、、三梯度洗脱可去除蛋白质污染。用稀酸缓冲洗阳离子交换柱，用稀碱缓冲液冲洗，把交换性能很强的盐去掉，再用水、、(除去固定相表面吸附的有机物)、、水，依次冲洗。
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保存色谱柱时，柱中应充满或，柱连接处应紧固，防止溶剂挥发干燥。请勿将缓冲液留在柱内待一夜或更久。8、在使用色谱柱时，如果压力升高，有一种可能是烧结过的滤片被堵塞，此时应更换滤片或取出清洗；还有一种可能是大分子进入柱内，使柱头受到污染；如果柱效降低或色谱峰变形，可能会出现柱头塌陷，体积增大。当出现后两种情况时，小心将柱头接头拧开，用洁净的小钢将柱头填料取出1~2 mm的高度(注意将污染的填料取净)再将柱内填料整平。接着将其填充到色谱柱中，用合适的溶剂润湿固定相(与柱相同)，压平，然后拧紧柱接头。这种处理后柱的效能有所提高，但难以恢复到新柱水平。柱失效一般为柱端，在分析柱前安装与分析柱相同固定相的短柱(5-30毫米)，可起到保护、延长柱寿命的作用。使用保护柱会失去一些柱效，这是值得的。
HPLC的 HPLC经验：【1】泵压跳动，跳动范围约10 bar。对策：原来的小白头有点脏，换了之后还没有解决；2、将主动阀上的阀芯取出后，发现类似气泡存在，在超声5分钟内浸入-水溶液中试着除去气泡，重新安装后观察，仍未解决；更换新阀芯，安装完毕后，再也没有跳动，观察一段时间后比较平稳，顺利解决。【2】失败原因：①plug homing over pressure②注浆和设流速时，无压力，无液体流出③检光闸不能复位④进完大浓度样品后，进空白相应位置也出峰。
起因：①在线过滤堵塞②泵头下订单向阀堵住③检测池很脏，也有可能是光路有些堵，再不行可能是灯寿命到了④抹布脏了，需要更换。对策：①在线滤网卸下，置烧杯，加纯化水煮沸5-10分钟后，超一下一般就可以了，如果还堵的话就拿稀泡，还不行，就换新的，这是个消耗品②将泵头下端向阀卸下，两个都可能堵死，刚卸下来时竖在耳边摇晃就听不到声音了。只要简单地拿起洗耳球将单向阀吹一次(注意方向)，吹了没反应可以拿溶剂超声检查，但不可用水煮，一般超至在耳边摇能听到声音就不会影响到。③先用溶剂将检测池冲洗一下，具体的试样用什么试样；若不冲洗，将检测池卸下，看灯能量，若能量还可以(有个几千)，可能得清洗光路。首先还是请工程师来清洁，因为要清理的零件在探测器下面有一个黑色的碎片，中间有一条缝，而且那一块的螺丝都是八角的，卸起来很麻烦。④拿出5个样品盘，可以看到里面有一个黑色凸起(看不清是用电筒)，平时进样针就是从那个地方吸的。伸手就能卸下来，里面有一个小白圈(用多了自然就黑了)，换一个新的就好了，一般只有10个才能买仪器。
六通阀的正确使用与维护①样品进样前，要用0.45μ的滤膜过滤，以减少微粒对进样阀的磨损。②旋转阀芯时不要太慢，不要停留在中间位置，否则流动相受阻，使泵内压力急剧上升，甚至超过了泵的压力；再转到进样位置，过高的压力会使柱头损坏。③为了防止进样阀内的缓冲盐及样品残留，每次分析结束后应冲洗进样阀。一般可采用清水冲洗，或先用溶样溶剂冲洗，再用清水冲洗。
有关流动相1.无过滤的流动相由于柱塞、密封环、气缸体和单向阀等杂质颗粒都会磨损，因此，应该预先清除流动相中的任何固体颗粒。好的流动相是在玻璃容器中蒸馏，而通常的过滤方法是滤过，可以使用 Millipore滤膜(0.2μ m或0.45μ m)等过滤器。泵入口处应接砂滤棒(或片)。应该经常清洗或更换输液泵的滤器。泵用后不能及时清洗移动相中不得含有腐蚀性物质，含有缓冲液的流动相不能留在泵中，特别是当泵停泵过夜或更久时。若含有缓冲液的流动相留在泵中，可能会析出盐的微晶，如上述固体颗粒那样损坏密封环和柱塞，甚至只是因为溶液处于静止状态时，会析出。所以，必须用纯水将泵完全清洗干净，然后换成适合于保存色谱柱和有利于泵维护的溶剂(对于反相键合硅胶固定相，可能是或-水)。
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固相萃取柱填料：
固相萃取填料通常是色谱吸附剂，可以分为三大类：第i一类是以硅胶为基质(如C18、C8等)；第二类是聚苯乙i烯-二乙烯苯等无机材料，如聚苯乙i烯-二乙烯苯等；另一类是以硅藻土、氧化铝、石墨化碳等为主要原料。
固相萃取柱容量：
柱的容量必须考虑到固相萃取柱的选择。因为我们所面对的样品基体往往比较复杂，如食物、生物样品等。固相萃取中，固相萃取吸附剂吸附目标化合物的同时，也吸附类似性质的杂质。所以在考虑柱容量时，应是总目标化合物加可吸附杂质含量不能超过柱容量。反之，可能会有部分目标化合物在载样过程中不能被吸附，导致回收率较低。
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固体萃取柱的用途：
大多数的固相萃取都是通过人工来完成的，即在固相萃取柱的上端连接一个注i射器，在注i射器的挤压下萃取柱中的液体被挤出。此外，也可采用正压
