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以下列出了一些色谱柱的清洗溶剂和顺序，作为参考：以正已烷(或庚烷)、和的硅胶柱依次冲洗，然后按相反的顺序冲洗，所有的溶剂必须严格脱水。可以清洗掉残留的强极性杂质，并对硅胶表面进行活化。反相柱用水、、、(或)依次冲洗，然后按反序冲洗。若下一步分析所用的流动相不含缓冲液，就可以忽略一步
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以下列出了一些色谱柱的清洗溶剂和顺序，作为参考：以正已烷(或庚烷)、和的硅胶柱依次冲洗，然后按相反的顺序冲洗，所有的溶剂必须严格脱水。可以清洗掉残留的强极性杂质，并对硅胶表面进行活化。反相柱用水、、、(或)依次冲洗，然后按反序冲洗。若下一步分析所用的流动相不含缓冲液，就可以忽略一步用水冲洗。可洗去残留的非极性杂质，多次在()冲洗时多次注射100-200μ l四氢，有助于去除强疏水性的杂质。四氢与或混合溶液可去除类脂。有时候还要注射几次二甲砜。用0.1%的、、三梯度洗脱可去除蛋白质污染。用稀酸缓冲洗阳离子交换柱，用稀碱缓冲液冲洗，把交换性能很强的盐去掉，再用水、、(除去固定相表面吸附的有机物)、、水，依次冲洗。
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保存色谱柱时，柱中应充满或，柱连接处应紧固，防止溶剂挥发干燥。请勿将缓冲液留在柱内待一夜或更久。8、在使用色谱柱时，如果压力升高，有一种可能是烧结过的滤片被堵塞，此时应更换滤片或取出清洗；还有一种可能是大分子进入柱内，使柱头受到污染；如果柱效降低或色谱峰变形，可能会出现柱头塌陷，体积增大。当出现后两种情况时，小心将柱头接头拧开，用洁净的小钢将柱头填料取出1~2 mm的高度(注意将污染的填料取净)再将柱内填料整平。接着将其填充到色谱柱中，用合适的溶剂润湿固定相(与柱相同)，压平，然后拧紧柱接头。这种处理后柱的效能有所提高，但难以恢复到新柱水平。柱失效一般为柱端，在分析柱前安装与分析柱相同固定相的短柱(5-30毫米)，可起到保护、延长柱寿命的作用。使用保护柱会失去一些柱效，这是值得的。
色谱柱如何冲洗？用于反相层析柱的冲洗：在下列溶剂中，每个色谱柱至少25 mL，清洗色谱柱无缓冲盐的流动相腈+25%异正己烷*如果使用己烷-冲洗色谱柱，则必须先用异冲洗色谱柱，然后再使用反相流相!!!用于正相色谱柱的冲洗：以50 mL以上的溶剂冲洗色谱柱(分析柱)。50%+50%醋酸。
气相色谱柱如何老化？装上色谱柱后，先将色谱柱加热至少3倍，再将载气流速调至正常流速，并从100度升温至老化温度升至老化温度。陈化温度——在样品分析终温20度以上，但未超过色谱柱恒温温度上限的状态下，通过恒温2小时的方法老化，新的毛细管色谱柱迅速老化，当色谱柱老化时，升温速度没有限制，可以用升温速率老化色谱柱。18.液相色谱仪的重要组成部分是什么？液体有什么检测器？脱气装置，泵，温度计，自动进样器，检测器。探测器有：VWD可变波长检测器、 DAD二极管阵列检测器、 MWD多波长检测器、 RID检测器、示差检测器、 FLD荧光检测器。溶剂进口过滤器如何选择？传统和毛细液相使用的溶剂过滤头有：20μ m玻璃过滤头(5041-2168)、 PTFE连接头(5062-8517)、不锈钢过滤头(5062-8517)、不锈钢过滤头(01018-60025)配制液相用的溶剂过滤头有：40μ m玻璃过滤头(3150-0944)和 PTFE接头头7 mm/4 mm (G1361-23204)如果流动相涉及下列溶剂，应避免使用不锈钢过滤头：碘化锂、、高浓度的及硫酸，有机酸溶液中的1%会腐蚀不锈钢、和异或 THF混合液等。每天用35%的浸泡玻璃滤芯一小时(不用超声波清洗，造成玻璃)。
四极离子阱， QTrap从技术上讲，传统的 QQQ四极杆增加了辅助射频，可以做选择性激发；或者从功能上来说，给 QQQ提供了多级串级功能。优点：具有 MRM、 SRM、中性丢失和多级串级功能，非常适合未知样品的结构分析。劣势：或者是分辨率太低代表产品：ABI/Sciex,QTrap5500系列质谱：世界上灵敏的离子阱系统。线形离子阱， Linear Ion Trap增强版的3D离子阱好处：与传统的3D离子阱相比，灵敏度提高了10倍以上；多层系列质谱。劣势：与 QqQ相比， MRM或中性丢失等特征群筛选功能不能进行。代表产品：Thermo公司的 LTQ XL线性离子阱质谱仪：增强的二维线性离子阱质谱仪，具有的灵敏度和超快的循环时间，能保证在的时间内，以少的样本获得的质谱信息。
线性与三维离子阱的比较研究这一对比也许是见的一幕-线型离子阱的灵敏度、分辨力、速度、通量等指标都优于传统的3D离子阱。线型离子阱市场严重蚕食了3D离子阱市场，尤其是在质谱市场，由于用户爱追新潮、求大求好，线型离子阱在市场上非常受欢迎。但事实上，线型离子阱在国外并不流行，尤其是一些老用户，因为习惯了离子阱的指标，对于价格高的线型离子阱并不太流行，尤其是一些离子阱老用户，对于价格高的线型离子阱来说，价格高的线型离子阱就不太流行了。四极杆飞行时间串联质谱， QTOFQMS采用 QMS作为质量过滤器， TOFMS作为质量分析工具。
在实际应用中，有几点需要注意：(1)流动相过滤在实际操作中由于不可能做到专瓶，容易造成交叉污染，对于复杂的配比流动相影响较大。因此，使用后一定要用水冲洗。在使用之前不放心的话也可以清洗。(2)流动相过滤经济成本较高。购买一套滤芯要3000多元，而且滤芯是比较容易损坏的设备。过滤器成本高，有的进口一片就要几十元。按照普通液相柱的正常使用寿命计算，过滤片的成本将远远高于色谱柱。而且在使用过滤片时，有些会引起流动相二次污染，原因是滤片不合格。(3)流动相过滤耗时较长。对于溶剂过滤器，有一个预清洗、安装、使用、使用后清洗、烘干的过程，也至少要有一个小时。这一代价也不容忽视。
造成堵塞的原因之二：使用流动相时细菌污染。指出：刚开始流动相无长菌性细菌，在使用中产生细菌污染。在使用多元液相色谱仪时，这主要是一个不健康的使用习惯。举例来说：50%流动的流动相，有两种使用方法。一种方法是在上机之前把水混合在一起，另一种方法是在流路 A放纯，而流路 B放纯水。就单纯的实验效果而言，后一种具有明显的优势：一是简单，无需另一种计算比例混合，二是比例，可以得到保留时间的重复性的实验效果。
