建筑设计
工业洁净室主要控制对象是灰尘，因此洁净室设计时，所用的材料不产尘、不积尘、耐摩擦。生物洁净室的主要控制对象是细菌，因此洁净室设计时，所有材料应耐水、耐腐、且不能提供微生物孽生繁殖条件。
检测设计
洁净室设计时，应为工业洁净室配备粒子计数器，用于检测瞬时灰尘粒子，而为生物洁净室配备培养皿，经过48小时培养，读出菌落数量，而不能测瞬时值。
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建筑设计
工业洁净室主要控制对象是灰尘，因此洁净室设计时，所用的材料不产尘、不积尘、耐摩擦。生物洁净室的主要控制对象是细菌，因此洁净室设计时，所有材料应耐水、耐腐、且不能提供微生物孽生繁殖条件。
检测设计
洁净室设计时，应为工业洁净室配备粒子计数器，用于检测瞬时灰尘粒子，而为生物洁净室配备培养皿，经过48小时培养，读出菌落数量，而不能测瞬时值。
物流设计
洁净室设计时，须为生物洁净室增加一道灭菌的过程，而工业洁净室则不需要。在人、物品、空气进入生物洁净室之前，都要进行灭菌。而风淋室、洁净服则是洁净室必备的。
气锁室一般设在洁净室的出入口，是用以阻隔外界或邻室气流和进行压差控制所设置的缓冲间。为了尽量减小微粒传递速度（通常大于0.5m/s）所需的空气总量，污染受控空间的所有门均应始终保持在关闭状态。若面积为2m2的区域的某扇门处于打开状态，则通过该门、并包含微粒的空气流量可达约3500m3/h；若面积为2m2的区域的某扇门处于关闭状态，则仅会有160m3/h空气通过该门的裂缝漏出，用以阻止微粒进入。
测试条件如不能满足规定的环境参数(温湿度、风速、换气次数、静压差在规定范围之内)要求，关键项目悬浮粒子、浮游菌或沉降菌的测试结果应视为无效。由于温度、相对湿度、风速、换气次数、静压差共同构成了洁净室的微气候，是洁净室维护正常与否的重要指征，可将关键工序关键项目测试修订为关键工序全性能测试。只有这样，才能、系统监测生产洁净室，为确保洁净室性能监测的数据科学性、准确性，测试部门在进行关键项目悬浮粒子、微生物测试时，应同时进行温度、相对湿度、换气次数、静压差等前提条件的测试。
高架地板
1、高架地板及其支撑结构，应符合设计和承重要求。安装前应检查出厂合格证和复核荷载检验报告，每种规格均应具有相应的检验报告。
2、铺设高架地板的建筑地面，应符合下列要求：
（1）地面标高应符合设计要求；
（2）地面表层应平整、光洁、不起尘，含水率不大于8%，并按设计要求涂刷涂料；
3、高架地板的面层和支承件，应平整、坚实，并具有、防霉变、防潮、难燃或不燃、耐污染、耐老化、导静电、耐酸碱等性能。
4、对有防静电要求的高架地板，安装前应核查产品出厂证明、合格证和防静电性能测试报告。
5、对有通风要求的高架地板，面层上的开孔率和开孔分布、孔径或边长等均应符合设计要求。
6、高架地板支撑立杆与建筑地面的连接或粘结应牢固可靠。支撑立杆下部的连接金属构件应符合设计要求，固定螺栓的外露丝扣不得少于3扣。
7、高架地板面层铺设允许偏差，应符合下表的规定。
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