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由于用户对样品的要求越来越高，样品也越来越复杂， MRM等三重四极杆技术已不能很好地处理各干扰问题。QTRAP6500+系统提高了对 MRM灵敏度的选择性，但不影响灵敏度。的 QTRAP三级质谱扫描功能(MS/MS/MS)使产品的质量选择有了很高的提高，新型的 SelexION+离子清洗法在质谱分离前增加一次正交分离。新型的 SelexION+离子传输能力比原系统提高了一倍，为复杂物质的定量检测提供了一种省时、简便的方法，以消除复杂化合物分析中的背景干扰。另外， SCIEXQTRAP系统还提供的扫描功能，包括增强质量扫描(EMS)、增强分辨率扫描(ER)、增强子离子扫描(EPI)等。该系统提供了大程度的灵活性和工作流选择，使得研究人员可以进行定量测量，并能进行更的识别。
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” SCIEX是为用户的定量需求不断提供智能技术改进。QTRAP6500+系统不仅具有较高的灵敏度和分离能力，而且具有较强的动态线性范围和稳定性。SCIEX副总裁兼LC-MS业务总监 ChrisRadloff表示：“SCIEX在推出QTRAP6500+的同时，也地扩展了用户的分析能力，尤其是在小分子和复合大分子分析应用领域。这种工艺设计使灵敏度和选择性更强。不管是低质或化合物，或正离子到负离子模式，一针进样，都能满足高灵敏度的可靠分析。该技术不仅可用于小、大分子生物分析，还可用于复杂食品残留量分析、环境分析、脂类分析和法医筛选。
先要认识到，一般国产其实不需要额外的过滤处理，直接使用是没有问题的。甚至某些固体颗粒杂质，都可以从液相流路系统前端的过滤头中排除。真正容易出现问题的是水中的细菌。新制纯水在室内放置数天后会产生细菌，而这些细菌虽然肉眼看不到，却足以堵塞柱状填料颗粒的空隙，导致柱子迅速报废。
色谱仪是一种易学难用的仪器，尤其注重仪器的正确使用。流体工作者接触到流动相，流动相是引起液相色谱各种问题的主要来源。液相色谱仪常见的故障有堵塞和漏漏。以下对这两点分别展开讨论。(注：流动相以为例，色谱柱以C18为例)“堵”的现象是柱压异常升高，直接原因是流路不畅。造成“堵塞”的原因：流动相中的细菌污染。阻塞主要发生在色谱柱前端，流动相中存在杂质，细菌是杂质的主要来源。长时间，滤头粘附细菌，造成泵液不能正常工作这一问题的解决办法就是保证水的可靠性。以下是两种建议方法：(1)好购买实验室纯水机，既方便又可靠，质量也放心。的缺点是价格昂贵。(2)成箱购买市售纯净水，如怡宝或娃哈哈500 ml，这些水的质量足以满足液相色谱的要求。有一个细节值得注意：在绝大多数书籍中，凡谈到配制流动相到都要进行过滤的步骤。
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固体萃取柱(SPE)是一种集选择性保留、选择性洗脱等分离技术，又称固相萃取法。复合样品溶液通过吸附剂(Sorbent)时，吸附剂通过极性相互作用、疏水作用或离子交换等作用力选择性地保留了目标物和少量与目标物相似的组分，其它组分通过该吸附剂流出小柱，然后用另一种溶剂体系选择性地将目标物洗脱，从而实现了复杂样品的分离纯化、浓缩和浓缩。“保持”(Retention)和“洗出”(Elution)都受到目标、吸附、溶剂等三个因素的影响，成功分离的关键是要对已知目标物进行适当的吸附、试样溶剂及洗脱溶剂。
全自动固相萃取仪能抵抗大部分化学物品的腐蚀，同时具有耐热、防火、防潮等功能。虽然物理功能很少被损坏，但即使它的性能再好，在使用期间也要定期维护。对设备的保养和使用寿命进行维护十分重要。
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层析柱的常见问题分为三个方面，即色谱柱污染、堵塞、固定相流失。造成色谱柱污染的原因通常是对高沸点杂质的吸附，会影响分析组分与固定相的正常吸附，导致基线噪声变大，产生前沿峰、拖尾峰、杂乱峰和未知峰等，解决色谱柱污染的常用方法是老化色谱柱，一般设置柱温温度极限30℃，老化10 h以上。细杂物质颗粒进入色谱柱导致柱子堵塞，导致基线电流增加、前沿峰、分叉峰、肩峰等异常峰形，甚至不出峰，一般情况下，要剪去柱子上几厘米的切割器(如毛细管切割器或金刚石玻璃刀)，切口要与柱子内壁成90°，而且要保证柱子切口干净，否则柱切口处产生的湍流涡旋将对峰的形状造成不利影响，对进样器和检测器的长度也有要求，通常插入进样器和检测器的深度分别为2.5 cm和8.5 cm [4]。由于固定相位丢失，柱效下降，基线漂移，基线电流增加，峰形不规则，柱效下降的严重程度可以通过降低柱温至室温，观察基线是否可调零来判断，可尝试剪掉色谱柱的一定距离，如果不可调零则表示固定相流失严重，则应更换新的色谱柱。
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