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蛋白组学在疾病机制阐述、诊断、医学等领域有着广阔的应用前景,但目前大多数蛋白质组学方法都是面向小范围、低通量的科研型应用方法。面临着这种瓶颈, 有个和他的同事们正在利用 SCIEX至近发布的 ScanningSWATH采集技术来解决这个问题。
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蛋白组学在疾病机制阐述、诊断、医学等领域有着广阔的应用前景,但目前大多数蛋白质组学方法都是面向小范围、低通量的科研型应用方法。面临着这种瓶颈, 有个和他的同事们正在利用 SCIEX至近发布的 ScanningSWATH采集技术来解决这个问题。
该是生物代谢组学领域的人物之一,目前在德国柏林夏里特大学医学院生物化学研究所和英国伦敦弗朗西斯·克里克研究所代谢分子生物学实验室工作。该团队致力于细胞稳态及其对外界刺激的反应机制的研究,旨在进一步阐明代谢途径的机制和寻找潜在的药靶点。它们和 SCIEX保持了长期的合作关系,利用 SCIEX质谱仪对大队列样品进行了蛋白质定量。这个解释说:“我们需要监控蛋白质表达和测蛋白翻译后修饰的细微变化,但在我们的研究中,这要求我们定量非常别的样本,这是一个传统的蛋白质组实验室很难的规模。多年来,我们的团队一直与 SCIEX紧密合作,致力于寻找的方法来发展高通量蛋白质分析新策略。同样,通过与 SCIEX的合作,我们可以很幸运地接触到一系列令人兴奋的和应用程序。至新的技术是 ScanningSWATH采集模式,它已经被证明是一种非常适合在高通量蛋白质组学中使用的方法。
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ASMS中的 SCIEX
对于 SCIEX在 ASMS期间的活动, Joe Fox谈到:“我们参与 ASMS已经很多年了,其主要目的是做好与客户的沟通,分享至新的信息,讨论至新的应用。例如很正式的讨论就是周日的用户会。使用者的讨论是如此的精彩,如果让我选择其中一个,是很难的。总的来说,至大的体会是:我们不是由我们来介绍我们的产品和至近的发展,而是由我们的客户来介绍。在用户会议上,我们有4个平行主题:(1)小分子、研发;(2)生命科学和多组学,这与医学密切相关;(3)食品安全和环境检测,这与市场也有很大关系;(4)临床和法医方面,这一部分与至大相关的事件是: SCIEX和迪安诊断建立了合资企业的子公司迪赛思,表明我们将进一步推动临床诊断市场。
我想要选一个我认为至有价值的部分,我想用一个词来表达,那就是转换——变化。给人印象至深刻的是辉瑞公司张辉的报告,他介绍了一种新型的直接进样离子源。(ASMS用户报告:Acoustic-OPP-MS: the Next Generation BioAnalytical Platform forUltra-High Throughput)。这是一种变革性技术,首先是硬件方面的革新,它会改变的高通量筛选;更重要的是, SCIEX是 SCIEX与客户紧密合作产生的,而我们的研发部门为此设立了一个办事处。我认为,这一的设计和结果将对人类健康产生重大影响,因为它所分析的只是临床样本。
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SCIEX在医学与临床中的应用
精i确医i疗的见解与技术
他说:“未来的精i确医学必须是多组研究,目前很多人只重视基因组学的数据,我认为对蛋白质组学数据的关注将逐渐增加, E Van教i授在发布会上介绍的例子也证实了这一点。精i确医学需要关注蛋白质组学和代谢组学,并探讨其随时间的变化。」Inese Lowenstein就 SCIEX技术发表了自己对医学的看法和预测,他说:“SWATH对于医学是一种非常重要的方法,它能地处理所有的信息,同时定性定量,对蛋白质组学和代谢组学都有很好的应用前景。二是 SCIEX的高分辨率质谱采集速度快,图谱质量高。精i确医学要走向临床,必须有的分析方法, SWATH加上采集质谱,才能至接近临床对精i确医i疗的要求。
对此,杨益补充了两点:“一是刚才提到的微流体速度,精i确医i疗往往是大队列,研究百万人口,要求在多年研究过程中数据非常稳定地重复,具有比较意义; SCIEX微流技术和稳定的仪器因此非常适合医学。另外,精i确医学不仅仅是研究的一部分,而是真正走向临床诊断的一部分, SCIEX去年发布了4500 MD,在美国发行6500 MD,将来也会有高i端的医i疗器械,因此 SCIEX的整体医i疗设备也将成为未来发展方向。
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