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“我在莫纳什大学工作五年,在实验室建立的早期,购买了几台 SCIEX仪器;至近,我们在整个系统中增加了两套 TripleTOF6600系统和 QTRAP6500+系统。实验中每一台设备都能24小时运转。研究发现阶段的实验中,每台仪器每天要处理13份样品,每份样品通常运行90
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“我在莫纳什大学工作五年,在实验室建立的早期,购买了几台 SCIEX仪器;至近,我们在整个系统中增加了两套 TripleTOF6600系统和 QTRAP6500+系统。实验中每一台设备都能24小时运转。研究发现阶段的实验中,每台仪器每天要处理13份样品,每份样品通常运行90分钟的纳流梯度。能处理各种样品,包括培养的细胞、组织活检标本、体液和组织。研究发现阶段对于理解疾病机制具有重要意义,可以保证我们所检测到的多肽都是与疾病相关且具有特异性的。该方法主要包括利用 TripleTOF获取高分辨率 MS/MS,进行发现阶段研究,转移至 QTRAP进行更敏感的靶向分析。MRM仍然是定量分析的黄金标准,在获取定量信息后,我常触发线性离子阱,采集全扫描的 MS/MS图谱,从而保证定量化合物的可信度。QTRAP是一种对低丰度肽的定量分析,它具有很好的灵敏度和重现性;使用该质谱平台后,我们把肽的检测限提高到了更高的数量级。”
”“我们是利用 SWATH采集技术分析的先驱之一,并已发表了一篇关于用多种紧密相关的人类白细胞抗原等位基因进行定量分析的1。SWATH方法非常有效,它能够定量分析超过3,000个肽段,即使是至好的 MRM试验也是如此。利用 SWATH技术,研究病原体相互作用,深入分析数据,查询含有至多成分的反应因子,或查毒或抗原表达物2。它帮助我们理解了许多病毒在阻碍早期反应时使用的小技巧。
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近视是一种日益普遍的眼病,它会导致人们在观察远处物体时变得模糊。利用蛋白质组学技术,香港科学家对影响眼睛正常发育和导致近视的因素进行研究。
蛋白组学是指在特定疾病状态下所涉及到的大量蛋白质,并从中找到影响人类和动物正常发育的外部环境或遗传因素。香港科技大学视光学院副 利用蛋白质组学技术,对多种眼疾进行研究,特别是近i视眼。该人描述了他在实验室里如何利用 SCIEX仪器进行研究:“我大约15年前从香港理工大学毕业,拿到了博士。长期以来,我对近视的研究非常感兴趣,这是我攻读博士期间研究的重点。但是在这之前,我们完全了解了蛋白质组学以及这项技术能够为我们提供更深入的信息。蛋白质组学对很多临床研究非常有用,如近视、青i光眼、黄斑变性、i感i染等。在蛋白质组学的研究中,发现新蛋白质间的相互作用可能会给带来更好的方法,因此我决定要在这方面进行一次探索。”
“眼睛是这类蛋白质组研究的理想模型,我们可以将一只病眼与一只健康的眼睛直接进行比较,因为它们的遗传模式是相同的。研究期间,曾用2- D凝胶技术来分析动物眼睛里的蛋白质,这非常耗时。但是到那时,几乎没有其他方法可供选择,对利用蛋白质组研究近视的技术几乎一无所知。另外,某些组织类型(如眼液)不能使用凝胶技术,这限制了我们的工作。只是在几年之后,人们才开始从使用二维凝胶技术转向使用液相色谱-质谱法,这促使我在7年前左右购买了离子阱和MALDI-TOF质谱仪。遗憾的是,我没有时间去理解这个系统的复杂性,这使我在硬件和软件使用上遇到困难,导致蛋白质组学研究被搁置数年。但是这些都是在我接触 SCIEX之前发生的。
蛋白组学在疾病机制阐述、诊断、医学等领域有着广阔的应用前景,但目前大多数蛋白质组学方法都是面向小范围、低通量的科研型应用方法。面临着这种瓶颈, 有个和他的同事们正在利用 SCIEX至近发布的 ScanningSWATH采集技术来解决这个问题。
该是生物代谢组学领域的人物之一,目前在德国柏林夏里特大学医学院生物化学研究所和英国伦敦弗朗西斯·克里克研究所代谢分子生物学实验室工作。该团队致力于细胞稳态及其对外界刺激的反应机制的研究,旨在进一步阐明代谢途径的机制和寻找潜在的药靶点。它们和 SCIEX保持了长期的合作关系,利用 SCIEX质谱仪对大队列样品进行了蛋白质定量。这个解释说:“我们需要监控蛋白质表达和测蛋白翻译后修饰的细微变化,但在我们的研究中,这要求我们定量非常别的样本,这是一个传统的蛋白质组实验室很难的规模。多年来,我们的团队一直与 SCIEX紧密合作,致力于寻找的方法来发展高通量蛋白质分析新策略。同样,通过与 SCIEX的合作,我们可以很幸运地接触到一系列令人兴奋的和应用程序。至新的技术是 ScanningSWATH采集模式,它已经被证明是一种非常适合在高通量蛋白质组学中使用的方法。
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SCIEX助力临床质谱应用:仪器寿命周期自动测试软件
IneseLowenstein表示,“对于技术不熟练的质谱使用者来说,如何让质谱使用体验更好,从质谱测试中获得更多有用的数据,的确是一个较大的挑战。要解决这个难题,需要质谱厂商提供更好的服务,我们要在应用技术支持和培训方面做好本地化工作,利用本地化培训等手段帮助用户解决以上问题。
因为临床应用对时间要求很高,因此其寿命和可靠性十分重要。例如,在时间上,医生们在等待手术结果决定如何移植的时候。而临床质谱必须非常可靠,并且可以保证超长时间运行,这对供货商的要求非常高,甚至超越了自动化。
SCIEX在自动化领域的重要投资是软件,而 SCIEXOS平台的设计方向是易于使用,自动化,让操作者以至简单的方式解决问题。与此同时软件还保留了灵活的空间,
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广东联方生物科技有限公司
张燕华(False) / |
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