如何确认RNA的质量
实时荧光定量PCR技术是通过测定RNA的转录水平来评估基因的活力。RNA样本提取的质量直接影响基因表达分析。影响RNA的因素有以下三种:RNA浓度、RNA纯度和RNA完整性。
检测RNA浓度、纯度和完整性的方式主要有以下几种:
紫外分光光度计法:
测量260nm吸收值计算RNA浓度,测量260
RNA提取试剂
如何确认RNA的质量
实时荧光定量PCR技术是通过测定RNA的转录水平来评估基因的活力。RNA样本提取的质量直接影响基因表达分析。影响RNA的因素有以下三种:RNA浓度、RNA纯度和RNA完整性。
检测RNA浓度、纯度和完整性的方式主要有以下几种:
紫外分光光度计法:
测量260nm吸收值计算RNA浓度,测量260nm/280nm吸收值的比值,用于评估RNA纯度。需要注意的是:在检测核酸物质时应该在固定的PH溶液中进行。
260nm/280nm的比值范围在 1.9~2.1 之间。<1.9,说明有蛋白质残留;>2.1,说明RNA可能发生降解。
琼脂糖凝胶电泳:
完整的RNA通常有三条带,zui亮的是28S条带,其次是18S条带,zui淡的是5S条带(部分试剂盒提取时会过滤掉5S条带)。通过琼脂糖凝胶电泳可以检测28S和18S的比值。该方法主要用于检测RNA的纯度和完整性。
如果28S和18S条带明亮、清晰、条带锐利,28S的亮度在18S条带的两倍以上,我们认为RNA的质量zui好。
若RNA条带出现弥散,原因可能:RNA被核酸酶降解、电压或电流过大、上样量过高或过低等。
tRNA二级结构
约50%碱基配对,形成四段双螺旋,与五段非配对序列形成三叶草形结构。
该结构中存在四臂四环:
①氨基酸臂。
②二氢尿C4H4N2臂(DHU臂、D臂)和二氢尿C4H4N2环(DHU环、D环),特征是含二氢尿C4H4N2(DHU、D)。
③反密码子臂和反密码子环,特征是反密码子环含反密码子。反密码子5′端与尿苷酸连接,3′端与piao呤核苷酸连接。TΨC臂(T臂)和TΨC环(Ψ环),特征是TΨC环含胸腺C4H4N2核糖核苷酸T54假尿苷酸Ψ55胞苷酸C56。
④额外环3~21nt。
tRNA三级结构呈L形,氨基酸结合位点位于其一端,反密码子环位于其另一端,DHU环和TΨC环虽然在二级结构中位于两侧,但在三级结构中却相邻。尽管各种tRNA的长度和序列不尽相同,但其三级结构相似,提示三级结构与其功能密切相关。
在整个核酸检测的过程中,zui大的挑战是什么?
不是实验室的负压状态,也不是全副武1装的超负荷工作,访问中工作人员不约而同地提到了一个词:准确。新型冠状病毒检测受到患者病程发展以及样本采集等诸多因素的影响,每一个样本都是一道待解的难题,需要排除各种干扰,才能找到准确结果。为了确保检测结果的准确性,只要检测结果存疑,就必须再次复核,还可能要重新检测。
医学实验室主要检测的是血液样本。医学实验室收到口岸送样后,登记、编号、录入信息,血常规检测为自动化操作,每个样本检测时间为1分钟,可实时获得口岸现场被采样入境人员的白细胞和淋巴细胞计数,作为新冠肺1炎的临床表现判断依据之一。卫生检疫综合实验室和医学实验室多种检测方法同时检测,综合判断,确保结果准确性。
鼻咽拭子的采集
被采集人员需要 保持头部不动,采样人员去除鼻腔内壁的分泌物。然后采样人员一手轻扶被采集人员头部,一手将鼻咽拭子缓缓插入鼻腔至鼻咽部。在鼻咽部,拭子将停留数秒吸取分泌物,而后采样人员轻轻旋转取出拭子,将样本保存并送检。
咽拭子的采集
被采集人员先用 生理盐水漱口,采样人员将拭子放入无菌生理盐水中湿润。被采集人员头部微仰并保持不动,嘴张大,并发“啊”音,露出两侧咽扁桃体,采集人员将拭子越过舌根,在被采集者两侧咽扁桃体稍微用力来回擦拭至少3次,然后再在咽后壁上下擦拭至少3次。
需要注意的是,两种采集方法, 被采集人员均会稍感不适,所以在采样的过程中,被采集人员需稍稍克服一下不适感, 配合采样人员的工作。不可过度活动头部,以免拭子划伤粘膜。如被采集人员发生刺激性咳嗽,采集过程需稍作暂停。
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