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絮凝剂分子结构的选择取决于所要求的脱水性能。阳离子絮凝剂的分子结构分为：线性结构、支状结构、交联网状结构
从以上几个方面我们不难发现，絮凝剂的选择是有很大的规律性的，只要我们用心去观察其规律，在日常应用中去总结，发现每一种废水都有其特定的那一种或几种絮凝剂可以满足污水处理絮凝或脱水状况。
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絮凝剂分子结构的选择取决于所要求的脱水性能。阳离子絮凝剂的分子结构分为：线性结构、支状结构、交联网状结构
从以上几个方面我们不难发现，絮凝剂的选择是有很大的规律性的，只要我们用心去观察其规律，在日常应用中去总结，发现每一种废水都有其特定的那一种或几种絮凝剂可以满足污水处理絮凝或脱水状况。
絮凝剂在不良条件下发生的导致絮凝性能下降的变化，通称为降解作用(degradation)，具体表现为分子量下降、溶液粘度降低、絮凝性能变差甚至失效。可能产生这种作用的因素很多。就此而言，高分子量的pam是相当“娇气”的物质。而且，pam的分子量越高，越容易产生这些变化，对有关的因素就越敏感。无机絮凝剂对废水的ph值比较敏感，由于絮凝剂水解反应不断产生氢离子，因此要保持水解反应充分进行。
分子结构
絮凝剂的品种繁多，从低分子到高分子，从单一型到复合型，总的趋势是向廉价实用、无毒的方向发展。无机絮凝剂价格便宜，但对人类健康和生态环境会产生不利影响；有机高分子絮凝剂虽然用量少，浮渣产量少，絮凝能力强，絮体容易分离，除油及除悬浮物效果好，但这类高聚物的残余单体具有“三致”效应(致崎、致癌、致突变)，因而使其应用范围受到限制；在矿工业中，通常使用大量的水，常须回收水中有用固体物，并将废水净化回收使用。微生物絮凝剂因不存在二次污染，使用方便，应用前景诱人。微生物絮凝剂将可能在未来取代或部分取代传统的无机高分子和合成有机高分子絮凝剂。
絮凝剂的分子质量、分子结构与形状及其所带基团对絮凝剂的活性都有影响。一般来讲，分子量越大，絮凝活性越高；线性分子絮凝活性高，分子带支链或交联越多，絮凝性越差；一般普通铁盐、铝盐的投加范围是10～100mg/L，聚合盐为普通盐投加量的1/2～1/3，有机高分子絮凝剂的投加范围是1～5mg/L。絮凝剂产生菌处于培养后期，细胞表面蔬水性增强，产生的絮凝剂活性也越高。处理水体中胶体离子的表面结构与电荷对絮凝效果也有影响。一些报道指出，水体中的阳离子，特别是Ca2+、Mg2+的存在能有效降低胶体表面负电荷，促进“架桥”形成。另外，高浓度Ca2+的存在还能保护絮凝剂不受降解酶的作用。微生物絮凝剂、安全、不污染环境的优点，在食品加工、生物产品分离等领域也有巨大的潜在应用价值。
“天然高分子絮凝剂的原料为可再生资源，无毒性、可生物降解，研究表明其可以和合成高分子絮凝剂相媲美。随着新科技的发展和对环保的更高要求，预测在21世纪的前30年，天然高分子絮凝剂会得到加速发展。
废水处理中投加絮凝剂可加速废水中固体颗粒物的聚集和沉降，同时也能去除部分溶解性有机物。这种方法具有投资少，操作简单，灵活等优点，特别适合于处理水量小，悬浮杂质含量较大的废水。采用无机絮凝剂时，因为投药量大，产生的污泥量也大，所以实际应用中主要采用人工合成有机高分子絮凝剂OPF，或采用无机絮凝剂与OPF相结合的方式。微生物絮凝剂的絮凝性能受诸多因素影响，内在因素包括絮凝基因的遗传和表达，外在因素则有微生物培养基的组成、细胞表面疏水性的变化、环境中二价金属离子的存在等。目前，国外已有性能良好的微生物絮凝剂商品，如日本生产的NOC--1。微生物絮凝剂从研究到生产的关键问题是发展成熟的微生物育种技术，同时努力降低生产成本。我国的微生物絮凝剂研制正朝着这一方向迈进，但是离工业化生产还有一定距离。在合成的有机高分子絮凝剂中，主要是聚烯酰胺（PAM）及其衍生物，在美国、日本其市场占有率达80%以上，在我国则年产近万吨。
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