RPA与LAMP对比
LAMP:环介导等温扩增法的特征是针对目标DNA链上的六个区段设计四个不同的引物然后再利用链置换反应在一定温度下进行反应。反应只需要把基因模板、引物、链置换型DNA合成酶、基质等共同置于一定温度下(60~65℃)、经一个步骤即可完成。
RPA:主要依赖于三种酶:能结合单链核酸(寡核苷酸引物)的重组酶、单链DNA结合蛋白(SSB)和链置换DNA聚
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RPA与LAMP对比
LAMP:环介导等温扩增法的特征是针对目标DNA链上的六个区段设计四个不同的引物然后再利用链置换反应在一定温度下进行反应。反应只需要把基因模板、引物、链置换型DNA合成酶、基质等共同置于一定温度下(60~65℃)、经一个步骤即可完成。
RPA:主要依赖于三种酶:能结合单链核酸(寡核苷酸引物)的重组酶、单链DNA结合蛋白(SSB)和链置换DNA聚合酶。
重组酶与引物结合形成的蛋白-DNA复合物,能在双链DNA中寻找同源序列。一旦引物定位了同源序列,就会发生链交换反应形成并启动DNA合成,对模板上的目标区域进行指数式扩增。被替换的DNA链与SSB结合,防止进一步替换。在这个体系中,由两个相对的引物起始一个合成事件。
TwistDx试剂盒
2018年,TwistDx推出了一系列全新的液态重组酶聚合酶扩增 (RPA)试剂盒,这些试剂盒非常适合需要不使用热循环仪就能在15分钟内完成 DNA/RNA 扩增的实验室以及想要灵活构建试验体系的研究人员使用。
TwistAmpLiquid试剂盒提供经甘油稳定化处理的液态RPA试剂,该形态对于在实验室执行 PCR 和其他基于酶的反应的任何人来说都非常熟悉。这些试剂各自装于单独的试管中,用户可随意从中移取任何量的酶混合液来构建自己所选的RPA反应体积,配制用于多次反应的预混液,或者以各种 RPA 组分比例进行实验以优化试验。
除了具有室温稳定性的冻干态TwistAmp RPA试剂盒这一旗舰产品,本次新推出的TwistAmp Liquid试剂盒是现场试验开发的理想之选。液体形态让实验室更容易地在日常工作中使用简单的RPA法(该方法有时甚至采用与PCR相同的引物)取代 PCR法,以及更容易地开发出定制的试验。
我国主要的几种检测试剂盒都是基于RT-PCR原理。因为需要检测的病毒样本浓度有高有低,高的容易检测,低浓度就会漏掉。所以PCR的方法就把病毒基因扩增很多倍,达到可以检测出来的浓度。基本操作如下:
01 收集咽拭子等病毒样本,通过试剂打碎保护病毒的蛋白质壳子,萃取病毒RNA。一方面是萃取,另一反面,打碎之后就没有了性,相对安全一些。
02 由于这次新冠是单链RNA病毒,所以要先转换成cDNA。这个可以类比像是视频文件,mp4,rmvb,avi这些都是常见格式,同一个视频不同格式,意思都一样,可以互相转换。
03 常规PCR反应,加热到94℃把DNA拉链拉开,之后再55℃-60℃让引物,就是拉链扣分别套在两条拉链上,再升温到72℃让拉链自己,用左拉链做模板造一个右拉链,用右拉链做模板造一个左拉链。这样折腾一次为一个循环,RNA数量翻一倍。之后再折腾25-30次。这样就算很少量的病毒这个时候也显现出来了。
至关重要的是,RPA 的技术增强了实验室外高度可访问和灵敏的核酸扩增,甚至是自我测试。在这里,我们回顾了 RPA 在其个十年发展过程中的无需设备的简单性。我们的综述包括 RPA 技术的关键知识,例如其反应成分、机制、灵敏度和特异性以及的检测方法。该综述还提供了开发 RPA 分析的专有技术,以及有关市售 RPA 反应试剂盒和附件的信息。
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