PCR革新技术-英国TwistDx Inc公司开发恒温扩增RPA
英国TwistDx Inc公司开发的重组酶聚合酶扩增(Recombinase Polymerase Amplification,RPA)--被称为是可以替代PCR的核酸检测技术,目前新的等温扩增检测技术。以此为基础的TwistAmp 核酸扩增产品,能够在15分钟内进行常温下的单分子核酸检测。该技术对硬件
进口TwistAmp nfo批发
PCR革新技术-英国TwistDx Inc公司开发恒温扩增RPA
英国TwistDx Inc公司开发的重组酶聚合酶扩增(Recombinase Polymerase Amplification,RPA)--被称为是可以替代PCR的核酸检测技术,目前新的等温扩增检测技术。以此为基础的TwistAmp 核酸扩增产品,能够在15分钟内进行常温下的单分子核酸检测。该技术对硬件设备的要求很低,特别适合用于体外诊断、兽医、食品安全、生物防御和农业等领域。
常规PCR必须经过变性、退火、延伸三个步骤,而PCR仪本质上就是一个控制温度升降的设备。RPA反应的适宜温度在37°C - 42°C之间,无需变性,在常温下即可进行。这无疑能大大加快PCR的速度。此外,由于不需要温控设备,RPA可以真正实现便携式的核酸检测。
据介绍,RPA检测的灵敏度很高,能够将痕量的核酸(尤其是DNA)模板扩增到可以检出的水平,从单个模板分子得到大约1012扩增产物。而且RPA还用不着复杂的样品处理,适用于无法提取核酸的实地检测。
RPA不仅可以对扩增产物进行终点检测,还可以对扩增过程进行实时监控,甚至可以通过试纸条(侧流层析试纸条LFD)读取结果。
目前,TwistAmp 试剂盒的扩增子长度在500bp以内。不过,经过特别优化的RPA扩增,也可以生成更长的扩增产物,或者减慢扩增速度(便于定量),甚至在更低的温度下进行反应。
TwistDx试剂盒
我国主要的几种检测试剂盒都是基于RT-PCR原理。因为需要检测的病毒样本浓度有高有低,高的容易检测,低浓度就会漏掉。所以PCR的方法就把病毒基因扩增很多倍,达到可以检测出来的浓度。基本操作如下:
01 收集咽拭子等病毒样本,通过试剂打碎保护病毒的蛋白质壳子,萃取病毒RNA。一方面是萃取,另一反面,打碎之后就没有了性,相对安全一些。
02 由于这次新冠是单链RNA病毒,所以要先转换成cDNA。这个可以类比像是视频文件,mp4,rmvb,avi这些都是常见格式,同一个视频不同格式,意思都一样,可以互相转换。
03 常规PCR反应,加热到94℃把DNA拉链拉开,之后再55℃-60℃让引物,就是拉链扣分别套在两条拉链上,再升温到72℃让拉链自己,用左拉链做模板造一个右拉链,用右拉链做模板造一个左拉链。这样折腾一次为一个循环,RNA数量翻一倍。之后再折腾25-30次。这样就算很少量的病毒这个时候也显现出来了。
常见的是核酸检测试剂盒。一般多为qpcr方法的,也有多重pcr的。检测新型冠状病毒特异序列的方法常见的是荧光定量PCR(聚合酶链式反应)。因PCR反应模板仅为DNA,因此在进行PCR反应前,应将新型冠状病毒核酸(RNA)逆转录为DNA。在PCR反应体系中,包含一对特异性引物以及一个Taqman探针,该探针为一段特异性寡核苷酸序列,两端分别标记了报告荧光基团和淬灭荧光基团。探针完整时,报告基团发射的荧光信号被淬灭基团吸收;如反应体系存在靶序列,PCR反应时探针与模板结合,DNA聚合酶沿模板利用酶的外切酶活性将探针酶切降解,报告基团与淬灭基团分离,发出荧光。每扩增一条DNA链,就有一个荧光分子产生。荧光定量PCR仪能够监测出荧光到达预先设定阈值的循环数(Ct值)与病毒核酸浓度有关,病毒核酸浓度越高, Ct值越小。不同生产企业的产品会依据自身产品的性能确定本产品的阳性判断值。
先说结论:目前的检测仍重度依赖核酸检测(以PCR技术为主),检测速度较慢(大 部分需要2小时以上),成本较高,且需要经训练的医护或实验人员来操控设备,因此无法实 现大规模检测。其他已商业化的检测试剂盒绝大多数依靠检测(IgG/lgM),可在10- 20分钟内获取检测结果,成本较低,操作简单,但是准确性较差,有较大的概率出现假阳性与假阴 性的情况,因此仅适用于大量地区粗略统计人数以及比例,或作为核酸检测的辅助指 标,其检测结果无法作为确定检测者与否的决定性指标,而目前能实现检测(10-20分 钟)且确保准确性的方法之一抗原检测,尚未有成熟的产品面世,仅有少数科技公司宣称近完成了产品开发。此外,基于CRISPR的检测技术的试剂盒可以为认为是核酸检测技术与检测 技术的一个折中,准确性高,速度较快,成本较低且操作简单,但由于技术相对新 颖,只有少数公司与研究机构完成了试剂盒的开发,产品尚未大规模推广。
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