RPA技术的基本原理
RPA技术主要依赖于三种酶:能结合单链核酸(寡核苷酸引物)的重组酶、单链DNA结合蛋白(SSB)和链置换DNA聚合酶。这三种酶的混合物在常温下也有活性,反应温度在37°C左右。
重组酶与引物结合形成的蛋白-DNA复合物,能在双链DNA中寻找同源序列。一旦引物定位了同源序列,就会发生链交换反应形成并启动DNA合成,对模板上的目标区域进行指数式扩
进口液态Basic试剂盒公司
RPA技术的基本原理
RPA技术主要依赖于三种酶:能结合单链核酸(寡核苷酸引物)的重组酶、单链DNA结合蛋白(SSB)和链置换DNA聚合酶。这三种酶的混合物在常温下也有活性,反应温度在37°C左右。
重组酶与引物结合形成的蛋白-DNA复合物,能在双链DNA中寻找同源序列。一旦引物定位了同源序列,就会发生链交换反应形成并启动DNA合成,对模板上的目标区域进行指数式扩增。被替换的DNA链与SSB结合,防止进一步替换。在这个体系中,由两个相对的引物起始一个合成事件。整个过程进行得非常快,一般可在十分钟之内获得可检出水平的扩增产物。RPA扩增的基础体系(TwistAmp Basic)含有DNA扩增所需的所有试剂,我们只要准备好引物和模板就行。扩增结果可以通过凝胶电泳进行终点检测,产物纯化后可用于下游研究。
在这个基础体系中添入不同的酶和探针,就可以实现多样化的RPA应用。举例来说,TwistAmp exo结合了的exo探针技术和核酸外切酶III,能实现数据的实时读取,就像荧光定量PCR一样。不过反应终点的扩增子总量有所减少,适合获得强荧光信号进行动力学分析,不适合终点检测(比如跑胶)。将exo探针技术、核酸外切酶III和逆转录酶结合起来,可以一步实现RNA模板的实时扩增。
RPA与LAMP对比
LAMP:环介导等温扩增法的特征是针对目标DNA链上的六个区段设计四个不同的引物然后再利用链置换反应在一定温度下进行反应。反应只需要把基因模板、引物、链置换型DNA合成酶、基质等共同置于一定温度下(60~65℃)、经一个步骤即可完成。
RPA:主要依赖于三种酶:能结合单链核酸(寡核苷酸引物)的重组酶、单链DNA结合蛋白(SSB)和链置换DNA聚合酶。
重组酶与引物结合形成的蛋白-DNA复合物,能在双链DNA中寻找同源序列。一旦引物定位了同源序列,就会发生链交换反应形成并启动DNA合成,对模板上的目标区域进行指数式扩增。被替换的DNA链与SSB结合,防止进一步替换。在这个体系中,由两个相对的引物起始一个合成事件。
即用型RPA检测试剂盒
客户采用RPA技术,可以根据自身需求开发自己的检测方法。在不同开发阶段所提供的这些即用型试剂盒内含有一整套用于检测主要食物病原体靶标的通用RPA试剂组分,灵活易用。
TwistDx公司曾经开发出系列即用型RPA检测试剂盒。例如,TwistAmp exo +试剂盒为用户提供了一个exo试剂盒,加上用于实时荧光检测的引物探针及阳性模板,该模板可与每次检测反应配合使用。TwistGlow 沙门氏菌(即用型,可用于实时荧光检测)和 TwistFlow 沙门氏菌(即用型,可用于终点侧流检测)试剂盒均为用户提供包含靶基因及内部质控引物探针反应组分、一个两步走的细胞裂解样本制备方法,以及可与每次试剂盒反应配合使用的模板。
目前,TwistDx公司在被雅培收购后,停产了部分产品,包括:TwistAmp Basic RT试剂盒、TwistAmp exo RT试剂盒、TwistAmp Liquid Basic RT 试剂盒和TwistAmp Liquid exo RT试剂盒、食品安全试剂盒(包括TwistAmp exo 弯曲菌属检测试剂盒(TwistAmp exo +Campylobacter)、TwistAmp exo 单核细胞李斯特菌检测试剂盒(TwistAmp exo +ListeriaM)、TwistGlow沙门氏菌检测试剂盒(TwistGlowSalmonella)和TwistFlow 沙门氏菌检测试剂盒(TwistFlowSalmonella )共四种)。
(作者: 来源:)