RPA技术的基本原理
RPA技术主要依赖于三种酶:能结合单链核酸(寡核苷酸引物)的重组酶、单链DNA结合蛋白(SSB)和链置换DNA聚合酶。这三种酶的混合物在常温下也有活性,反应温度在37°C左右。
重组酶与引物结合形成的蛋白-DNA复合物,能在双链DNA中寻找同源序列。一旦引物定位了同源序列,就会发生链交换反应形成并启动DNA合成,对模板上的目标区域进行指数式扩
进口TwistAmp Liquid exo批发
RPA技术的基本原理
RPA技术主要依赖于三种酶:能结合单链核酸(寡核苷酸引物)的重组酶、单链DNA结合蛋白(SSB)和链置换DNA聚合酶。这三种酶的混合物在常温下也有活性,反应温度在37°C左右。
重组酶与引物结合形成的蛋白-DNA复合物,能在双链DNA中寻找同源序列。一旦引物定位了同源序列,就会发生链交换反应形成并启动DNA合成,对模板上的目标区域进行指数式扩增。被替换的DNA链与SSB结合,防止进一步替换。在这个体系中,由两个相对的引物起始一个合成事件。整个过程进行得非常快,一般可在十分钟之内获得可检出水平的扩增产物。RPA扩增的基础体系(TwistAmp Basic)含有DNA扩增所需的所有试剂,我们只要准备好引物和模板就行。扩增结果可以通过凝胶电泳进行终点检测,产物纯化后可用于下游研究。
在这个基础体系中添入不同的酶和探针,就可以实现多样化的RPA应用。举例来说,TwistAmp exo结合了的exo探针技术和核酸外切酶III,能实现数据的实时读取,就像荧光定量PCR一样。不过反应终点的扩增子总量有所减少,适合获得强荧光信号进行动力学分析,不适合终点检测(比如跑胶)。将exo探针技术、核酸外切酶III和逆转录酶结合起来,可以一步实现RNA模板的实时扩增。
TwistDx相关问题
1. RPA能实现多重化吗
可以。RPA技术支持在同一个管中同时进行多个扩增反应。不过,多重化的引物组合需要精心设计,以便每个引物都能同样有效的工作。需要注意的是,RPA反应的引物总量(nmol)尽量不要超标太多。如果在-一个反应中使用两个以上的扩增引物,就应该控制不同引物的量。另外,我们应当事先考虑好检测多个扩增事件的探针、设备以及荧光团的兼容性。
2.能否对模板进行定量
可以。扩增子达到可检出水平的时间,依赖于反应起始时的模板量。初始模板的拷贝越多,扩增子就越快达到可检出水平。不过,这种定量需要精心的实验安排,确保对照反应是同时开始的。举例来说,可以利用镁离子的添加时间进行控制。因为镁离子一一旦进入体系,RPA反应就会开始。此外,较慢的扩增过程有助于更精准的定量。我们可以通过调整反应条件或引物设计来减慢RPA的反应速度。
3能否进行荧光终点分析
可以。这样比较的是反应开始时的荧光和反应结束时的荧光,荧光增强意味着发生了扩增。
4能否支持生物素或荧光标记的寡核苷酸
支持。在RPA反应中,连有生物素或荧光团的引物与未修饰的引物表现差不多。据悉还没有发现任何差异。
5跑胶前需要回收RPA产物吗
需要。RPA反应中的物质会干扰琼脂糖电泳,如果不进行产物回收,跑出来的带会出现拖尾。

TwistDx试剂盒
DNA检测的原理是聚合酶链式反应(PCR)。如果你了病毒,那么应该能检测到病毒的核酸,我们可以利用体外DNA扩增的方式扩增这些核酸并检测。PCR就是一种体外DNA扩增的技术,简单来说就是可以让特定的DNA分子一条链变两条链,两条变四条,四条变八条,每个循环翻一倍。然后通过看经过多少个循环这个DNA分子的数量超过阈值,就可以计算原本样品中DNA的量(也就是说每少一个循环超过阈值说明病毒核酸的量多一倍)。一个30循环的PCR反应大概需要两小时。算上样品处理等时间应该会在四到五个小时左右,如果要等其他人一起做则更久。
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