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蛋壳表面有许多气孔,用于胚胎的气体交换。它不象哺乳动物胚胎的呼吸需要由母体提供,而是依靠一种基本简单的扩散原理,例如,氧气、二氧化碳等这些气体经蛋壳孔,从高浓度一边扩散到低浓度一边。空气中的氧气约20%经气孔穿过蛋壳进入蛋内,胚胎利用这些氧气氧化营养物质并产生大量的二氧化碳和水(水汽),并从蛋内流到含量低的大气层内。
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大约16日龄时,鸡胚的头部朝向气室端,到19日龄它的呼吸需要氧气,且二氧化碳废气量比原来提高了100倍。此时简单的扩散呼吸已不能再维持此种需要。它用喙击穿完膜,进入气室,开始肺呼吸,与此同时,也进行简单扩散呼吸.这或许是解释胚蛋小头朝上放置时,孵化率对20%及孵出的雏鸡质量低下的原因。
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