试验结果表明，生物有机肥可有效促进果树的生长发育。研究表明，设施桃树上施用生物有机肥后，显着提高了土壤温度，10厘米根际土壤温度平均升高2.2℃；促进了土壤表层根系的发生与生长，细根数量比对照增加1.5倍；明显提高了设施内桃的坐果率，比对照提高45.6%；成熟期提前，比对照早熟10-12天。在设施草莓上施用生物有机肥后，植株生长明显改善，所有指标均高于对照，根呼吸强度和根系生长点数分别增加2.5倍和1.2倍，新根总表面积和根冠比分别增加117.3%和44.9%，叶片光合强度提高70%以上。
微生物菌肥不宜与杀菌剂、杀虫剂、除草的剂同时使用，也不要在使用生物菌肥后再实行土壤消毒。生物菌肥适宜的土壤湿度为60%左右，所以要注意不要在过分干旱时使用。生物菌肥对于阳光中的紫外线敏感，不宜采用地表撒施，可以在阴天或清晨、傍晚于土壤中施用。生物菌肥施入土壤后，有一个菌群繁殖壮大的过程，因此，在果树根系开始生长前使用。
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