有机肥可以增加作物产量，改善农产量 在同等营养元素的条件下，有机肥与化肥相比较，在作基肥施用时，一般有机肥比化肥效果要好，在作追肥施用时，经过充分腐解的有机肥其效果常常也比化肥要好。尤其是提高农产品比化肥更为有利。我国农民有使用有机肥的传统，十分重视有机肥的使用。美国、西欧、日本等发达，正在兴起”生态农业””有机农业”，十分重视使用有机肥料，并把有机肥料规定为生产的主要肥源。
堆肥过程主要靠微生物的作用进行，微生物是堆肥发酵的主体。参与堆肥的微生物有两个来源：一是有机废弃物里面原有的大量微生物；另一是人工加入的微生物接种剂。这些菌的种在一定条件下对某些有机废物具有较强的分解能力，具有活性强、繁殖快、分解有机物迅速等特点，能加速堆肥反应的进程，缩短堆肥反应的时间。 堆肥一般分为好氧堆肥和厌氧堆肥两种。好氧堆肥是在有氧情况下的有机物料分解过程，其代谢产物主要是二氧化碳、水和热；厌氧堆肥是在无氧条件下有机物料的分解过程，厌氧分解的代谢产物是CH4、二氧化碳和许多低分子量的中间产物，如有机酸等。
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