微生物肥料（菌肥）的主要功效是促进植物根系的发育。人粪尿中常混有病菌和虫卵，施前应进行无害化处理，以免污染环境。只要我们能知道植物根系的重要性，就能知道微生物有机肥内含的多种功能性微生物进入土壤后，在生长繁殖过程中产生大量的次生代谢产物，这些产物能够促进土壤团粒结构的形成。团粒结构的形成能使土壤变得疏松、绵软，保水保肥性能增强，水、气、热更加协调，减少土壤板结，有利于保水、
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微生物肥料（菌肥）的主要功效是促进植物根系的发育。人粪尿中常混有病菌和虫卵，施前应进行无害化处理，以免污染环境。只要我们能知道植物根系的重要性，就能知道微生物有机肥内含的多种功能性微生物进入土壤后，在生长繁殖过程中产生大量的次生代谢产物，这些产物能够促进土壤团粒结构的形成。团粒结构的形成能使土壤变得疏松、绵软，保水保肥性能增强，水、气、热更加协调，减少土壤板结，有利于保水、保肥、通气和促进根系发展，为农作物提供舒适的生长环境
生物肥料（微生物肥料）的种类较多，按照制品中特定的微生物种类可分为菌肥料（如根瘤菌肥、固氮菌肥）、线菌肥料（如抗生菌肥料）、菌类肥料（如菌根菌）；按其作用机理分为根瘤菌肥料、固氮菌肥料（自生或联合共生类）、解磷菌类肥料、硅酸盐菌类肥料；按其制品内含分为单一的微生物肥料和复合（或复混）微生物肥料。复合微生物肥料又有菌、菌复合，也有菌和各种添加剂复合的。有机肥料有机肥料（manure）天然有机质经微生物分解或发酵而成的一类肥料。
有机肥料的作用有以下两方面：(1）改良土壤，培肥地力。有机肥料中的主要物质是有机质，施用有机肥料增加了土壤中有机质的含量。有机质可以改善土壤物理、化学和生物特性，熟化土壤，培肥地力。在生育期较短的第三、四积温带，生物有机复合肥可替代化肥进行一次性施肥，降低生产成本。（2）增加作物产量和提高农产品，氨基酸等物质，不氮、磷、钾等养分外，还含有多种糖类，氨基酸等物质，不仅可为作物提供营养，而且可以促进土壤微生物的活动。有机肥料还含有多种微量元素，如畜禽粪便每100千克中含硼2.2～2.4克，锌2.9～29.0克，锰14.3～26.1克，钼0.3～0.4克，有效铁2.9～29.0克。有机肥和化肥配合施用增产效果显著，而且能改善产品的，使蔬菜中肖酸盐、亚肖酸盐含量降低，维生素C含量提高，增加瓜果中的含糖量。
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