化学污染包括有机物污染和无机物污染。有机物污染主要是有机试剂污染和有机样品污染。在大多数情况下，实验室中的有机试剂并不直接参与发生反应，仅仅起溶剂作用，因此消耗的有机试剂以各种形式排放到周边的环境中，排放总量大致就相当于试剂的消耗量。日复一日，年复一年，排放量十分可观。有机样品污染包括一些的有机样品，如、苯并(α)芘、、亚等。无机物污染有强酸、强碱的污染，重金属污染，污染等。其中、、
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化学污染包括有机物污染和无机物污染。有机物污染主要是有机试剂污染和有机样品污染。在大多数情况下，实验室中的有机试剂并不直接参与发生反应，仅仅起溶剂作用，因此消耗的有机试剂以各种形式排放到周边的环境中，排放总量大致就相当于试剂的消耗量。日复一日，年复一年，排放量十分可观。有机样品污染包括一些的有机样品，如、苯并(α)芘、、亚等。无机物污染有强酸、强碱的污染，重金属污染，污染等。其中、、铅、镉、铬等重金属的毒性不仅强，且有在人体中有蓄积性。
质量管理体系是把实验室的质量方针目标、组织架构、设施环境、仪器设备、试剂耗材、人员的权利职责、作业程序、管理程序、、信息系统、文件控制、结果报告、咨询服务、投诉处理、纠正改进等要素协调起来的统一整体。质量体系是否完善直接关系到患者及送检医师对分子病理实验室各项检测结果报告的可信度和满意度。因此必须将包括管理文件、程序文件和作业指导书（SOP）在内的质量体系文件，传达至所有相关人员，保证相关人员充分理解并执行此文件。更为重要的是，要对日常检测工作流程进行全程质量控制，保证检测结果的准确客观。
目前临床实验室中使用的全自动生化分析仪一般采用多通道分析，其试剂位应能满足常规生化检验项目的需要，当实验室使用双试剂时，要求仪器时试剂位相应增加，如需在仪器运行过程中加载试剂，多数设备要求进入专门的试剂加载程序，并在测定间隙完成试剂加载。PCR实验室根据使用仪器的功能合理设置各个工作区域，如采用聚合酶联反应：则设置试剂储存和准备区、标本制备区、扩增区、扩增产物分析区四个单独的工作区域，这是的分区方式。样品需要粉碎处理的，还需增设样品粉碎区；若使用实时荧光PCR法：基因扩增区、基因产物分析区可以合并在一个房间内；采用标本处理、核酸提取及扩增检测为一体的全自动化PCR分析仪，则标本制备区、扩增区、扩增产物分析区可合并为一个区域，因此PCR实验室原则上设置五个区或四个区或三个区或二个单独的工作区。
试剂和消耗品应有库存控制系统：库存控制系统应当包括所有相关试剂、控制物质和校准品的批号记录，实验室接收日期及投入使用日期记录。、物品的使用严格遵守操作规程。 实验室要符合防火规范。 化学试剂的储存要分类，严禁物品与助燃物、氧化剂混放。遇水燃烧的物质要注意防水、防潮。有毒有害试剂必须有专人进行管理。 实验用的各种气瓶的存在、使用要严格遵守规程。 防护器材、灭火器材要有专人负责维护、保养，确保良好使用。 各种仪器及电气设备要经常进行检查。防止发生触电事故及电气火灾事故。
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